RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 FGFR4P22455 802 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 ALX1Q15699 326 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 USP27XA6NNY8 438 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 KCNN4O15554 427 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 RARBP10826 455 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 CHRNA3P32297 505 aa23.67■■□□□ 1.38
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PTPRM-201ENST00000332175 BFARQ9NZS9 450 aa23.67■■□□□ 1.38
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PTPRM-201ENST00000332175 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
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PTPRM-201ENST00000332175 C12orf60Q5U649 245 aa23.66■■□□□ 1.38
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PTPRM-201ENST00000332175 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 SNX9Q9Y5X1 595 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.66■■□□□ 1.38
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PTPRM-201ENST00000332175 ATP6V1E1P36543 226 aa23.66■■□□□ 1.38
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PTPRM-201ENST00000332175 AIPL1Q9NZN9 384 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 SERPIND1P05546 499 aa23.65■■□□□ 1.38
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PTPRM-201ENST00000332175 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa23.64■■□□□ 1.38
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PTPRM-201ENST00000332175 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.64■■□□□ 1.37
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PTPRM-201ENST00000332175 SCP2P22307 547 aa23.64■■□□□ 1.37
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PTPRM-201ENST00000332175 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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PTPRM-201ENST00000332175 CLCA2Q9UQC9 943 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA8RI6L899 631 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 TAGAPQ8N103 731 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 ATP11CQ8NB49 1132 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 DCUN1D1Q96GG9 259 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 YIPF2Q9BWQ6 316 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 TEX12Q9BXU0 123 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 NBPF26B4DH59 902 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 KYAT1Q16773 422 aa23.63■■□□□ 1.37
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