RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RRN3-202ENST00000327307 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa7.47□□□□□ -1.21
RRN3-202ENST00000327307 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
RRN3-202ENST00000327307 UQCRHLA0A096LP55 91 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 HDAC3O15379 428 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ASAP2O43150 1006 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 FSBPO95073 299 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 MT-CO1P00395 513 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 UQCRHP07919 91 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 CDK4P11802 303 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 CKMT1AP12532 417 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 IL11P20809 199 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 MC4RP32245 332 aa7.46□□□□□ -1.22
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RRN3-202ENST00000327307 HOXD13P35453 343 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 SLC12A3P55017 1021 aa7.46□□□□□ -1.22
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RRN3-202ENST00000327307 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 TMC6Q7Z403 805 aa7.46□□□□□ -1.22
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RRN3-202ENST00000327307 HGH1Q9BTY7 390 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 NMRK2Q9NPI5 230 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 UBP1Q9NZI7 540 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
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RRN3-202ENST00000327307 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
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RRN3-202ENST00000327307 B2RBV5 119 aa7.45□□□□□ -1.22
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RRN3-202ENST00000327307 KRIT1O00522 736 aa7.45□□□□□ -1.22
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RRN3-202ENST00000327307 OR5F1O95221 314 aa7.45□□□□□ -1.22
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RRN3-202ENST00000327307 CRYMQ14894 314 aa7.45□□□□□ -1.22
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RRN3-202ENST00000327307 STK38Q15208 465 aa7.45□□□□□ -1.22
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RRN3-202ENST00000327307 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.45□□□□□ -1.22
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RRN3-202ENST00000327307 PALM2Q8IXS6 379 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ZNF565Q8N9K5 539 aa7.45□□□□□ -1.22
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RRN3-202ENST00000327307 MENTQ9BUN1 341 aa7.45□□□□□ -1.22
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RRN3-202ENST00000327307 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa7.45□□□□□ -1.22
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RRN3-202ENST00000327307 BCRP11274 1271 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ID4P47928 161 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 CPT1AP50416 773 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 PLCD1P51178 756 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 CLCN4P51793 760 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 CSNK2BP67870 215 aa7.45□□□□□ -1.22
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