RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP120Q8N960 986 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSLNLQ96KJ4 702 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARVGQ9HBI0 331 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 GDAQ9Y2T3 454 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 MUC3AQ02505 3323 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 FSD2A1L4K1 749 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRXCR2A6NFK2 248 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFEMP2O95967 443 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTSAP10619 480 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 STRN3Q13033 797 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNC3Q14003 757 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLUL1Q15846 466 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 FIZ1Q96SL8 496 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 CITO14578 2027 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 K7ENM7 598 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBCAO75347 108 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRD1O95696 1058 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCF2P10911 925 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRM5P41594 1212 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPN14Q15678 1187 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAB2Q15742 525 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPZL3Q6UWV2 235 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB33Q86T24 672 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYCT1Q8N699 235 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD207Q9UJ71 328 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 IRAK3Q9Y616 596 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 H0YCG3 227 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXCL14O95715 111 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 CA8P35219 290 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 STAT6P42226 847 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUSC3Q13454 348 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZPBP2Q6X784 338 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZHX3Q9H4I2 956 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 STK39Q9UEW8 545 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 MBTPS2O43462 519 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAK2O60296 914 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 NR1I2O75469 434 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOM1L1O75674 476 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOD2P04179 222 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 OSTNP61366 133 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 COASYQ13057 564 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 DYMQ7RTS9 669 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 RABGGTAQ92696 567 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCHPQ9BT92 498 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 PANK2Q9BZ23 570 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYMKA6NI61 221 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFRSF10AO00220 468 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 CUTAO60888 179 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 THP07101 528 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHC4Q6S5L8 630 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 SV2BQ7L1I2 683 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDILTQ8N807 584 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMRP1Q8NCR6 262 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX12PQ92771 950 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX27Q96L92 541 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBX20Q9UMR3 447 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIGRP01833 764 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCP2P22307 547 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 NMT1P30419 496 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCL1Q07820 350 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 E2F4Q16254 413 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 XKR4Q5GH76 650 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATL3Q6DD88 541 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 FUT10Q6P4F1 479 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms