RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 REEP2Q9BRK0 252 aa15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 KLHL11Q9NVR0 708 aa15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 CLIC5Q9NZA1 410 aa15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa15.68■□□□□ 0.1
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CCNDBP1-201ENST00000300213 MTHFD1LQ6UB35 978 aa15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCTD1Q719H9 257 aa15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKMY2Q8IV38 441 aa15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 TPH2Q8IWU9 490 aa15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 KLHL23Q8NBE8 558 aa15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 CEP95Q96GE4 821 aa15.68■□□□□ 0.1
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CCNDBP1-201ENST00000300213 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 BTKQ06187 659 aa15.67■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZCWPW2Q504Y3 356 aa15.67■□□□□ 0.1
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CCNDBP1-201ENST00000300213 TTC17Q96AE7 1141 aa15.67■□□□□ 0.1
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CCNDBP1-201ENST00000300213 CALCAP01258 141 aa15.67■□□□□ 0.1
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PLVAPQ9BX97 442 aa15.67■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRMDAQ9H2I8 198 aa15.67■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 PSTPIP2Q9H939 334 aa15.67■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF711Q9Y462 761 aa15.67■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYO3BQ8WXR4 1341 aa15.67■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 TBX10O75333 385 aa15.67■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 CIB2O75838 187 aa15.67■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ENO1P06733 434 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 PCP11498 1178 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRT5P13647 590 aa15.67■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ACADSP16219 412 aa15.67■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 VCAM1P19320 739 aa15.67■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 RASA1P20936 1047 aa15.67■□□□□ 0.1
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CCNDBP1-201ENST00000300213 SYCP2LQ5T4T6 812 aa15.67■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNF43Q68DV7 783 aa15.67■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa15.67■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP15.67■□□□□ 0.11e-7■■■■□ 19.6
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PKD2L1Q9P0L9 805 aa15.67■□□□□ 0.1
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CCNDBP1-201ENST00000300213 H3BRJ5 948 aa15.66■□□□□ 0.1
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PTPN4P29074 926 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 GCLMP48507 274 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 GPC5P78333 572 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYL7Q01449 175 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC5A9Q2M3M2 681 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ACSBG2Q5FVE4 666 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 TTBK2Q6IQ55 1244 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 GRAMD1AQ96CP6 724 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF333Q96JL9 665 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 RILPQ96NA2 401 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 RUSC1Q9BVN2 902 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 TXLNGYQ9BZA5 131 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa15.66■□□□□ 0.1
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CCNDBP1-201ENST00000300213 MAP7Q14244 749 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 EPHA7Q15375 998 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 USH1GQ495M9 461 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 FRMD5Q7Z6J6 570 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC35C1Q96A29 364 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC127Q96BQ5 260 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 THTPAQ9BU02 230 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAJC18Q9H819 358 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF148Q9UQR1 794 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM182AQ5T1J6 154 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 IZUMO3Q5VZ72 239 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLFN11Q7Z7L1 901 aa15.66■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 A6NJR5 290 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC22O60826 627 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 BAG3O95817 575 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 LMNAP02545 664 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 NOP14P78316 857 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC34A1Q06495 639 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 C1orf146Q5VVC0 180 aa15.65■□□□□ 0.1
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