RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 FAM228BP0C875 321 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 AKR1A1P14550 325 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 TNNI1P19237 187 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 MAGEA1P43355 309 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 PSMC4P43686 418 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 WNT7BP56706 349 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 MCL1Q07820 350 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 ATF7IP2Q5U623 682 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 MPZL3Q6UWV2 235 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 SV2AQ7L0J3 742 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 ZBTB33Q86T24 672 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 LMBR1Q8WVP7 490 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 SEMA4DQ92854 862 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 SCLT1Q96NL6 688 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 NT5C1BQ96P26 610 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 PPP1R16BQ96T49 567 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 AP5M1Q9H0R1 490 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 IFT122Q9HBG6 1241 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 PTPRJQ12913 1337 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 A0A087WZ62 844 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 MACROD2A1Z1Q3 448 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 CTAGE9A4FU28 777 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 RRN3P2A6NIE6 340 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 ABLIM1O14639 778 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 OGTO15294 1046 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 B4GALT5O43286 388 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 ZEB2O60315 1214 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 PROZP22891 400 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 PIK3CAP42336 1068 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 CHMP4BP1P59074 171 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 MFSD10Q14728 455 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 FAM187BQ17R55 369 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 KIAA0753Q2KHM9 967 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 ZACNQ401N2 412 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 MARCH8Q5T0T0 291 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 PPM1KQ8N3J5 372 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 CGRRF1Q99675 332 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 MINDY3Q9H8M7 445 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 RAB20Q9NX57 234 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 Q9Y3F1 56 aa11.36□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 NRCAMQ92823 1304 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 PJA2O43164 708 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 AOC2O75106 756 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 TNFSF9P41273 254 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 BIRC3Q13489 604 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 SEZ6Q53EL9 994 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 NLRP7Q8WX94 980 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 KAT2BQ92831 832 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 CAPNS2Q96L46 248 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 C1orf112Q9NSG2 853 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 SETD4Q9NVD3 440 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 TNFSF13BQ9Y275 285 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 ATP8B3O60423 1300 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 TBC1D8O95759 1140 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 MYL3P08590 195 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 IQCF3P0C7M6 154 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 CYBAP13498 195 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 PSEN2P49810 448 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 MFAP3P55082 362 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 KIF22Q14807 665 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 C10orf76Q5T2E6 689 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 MFSD14CQ5VZR4 134 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 NFRKBQ6P4R8 1299 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 ZNF410Q86VK4 478 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 TRIB2Q92519 343 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 ZNF516Q92618 1163 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 KAT5Q92993 513 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 FAM84AQ96KN4 292 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 KATNAL1Q9BW62 490 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 CDT1Q9H211 546 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 PTPRHQ9HD43 1115 aa11.35□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 TRIP11Q15643 1979 aa11.34□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 THSD7BQ9C0I4 1608 aa11.34□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 SLU7O95391 586 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 HLA-DRAP01903 254 aa11.34□□□□□ -0.59
COPS2-201ENST00000299259 FLT3LGP49771 235 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms