RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINB4P48594 390 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 FAM205CA6NFA0 338 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 PSMD14O00487 310 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PQJ5 194 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 IFNA8P32881 189 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 TRABDQ9H4I3 376 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 PPCSQ9HAB8 311 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 POU5F1BQ06416 359 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 NAB2Q15742 525 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 CEP19Q96LK0 163 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 YY1AP1Q9H869 796 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 OCA2Q04671 838 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 FMO5P49326 533 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 STK4Q13043 487 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 MAPRE2Q15555 327 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 RGL1Q9NZL6 768 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 MYL3P08590 195 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 RAD23BP54727 409 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 AP1B1Q10567 949 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD7Q92527 254 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 HPS3Q969F9 1004 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2C19P33261 490 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 COPB2P35606 906 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 RASSF3Q86WH2 238 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 A8MXQ7 604 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 KCNV2Q8TDN2 545 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 APOL1O14791 398 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 DGAT1O75907 488 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ACTR2P61160 394 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM259Q4ZIN3 620 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ULK4Q96C45 1275 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ADA2Q9NZK5 511 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 SNX5Q9Y5X3 404 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 PIK3R2O00459 728 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 PDHA1P08559 390 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 SRLQ86TD4 932 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF560Q96MR9 790 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 TCP11X1B4DZS4 312 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 BNIP3LO60238 219 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 AGBL2Q5U5Z8 902 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 OLFM3Q96PB7 478 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ICA1LQ8NDH6 482 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 SGSM3Q96HU1 749 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 MS4A14Q96JA4 679 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP10A1A4S6 786 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEP78395 509 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ZFATQ9P243 1243 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ANTXR2P58335 489 aa22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 CEP70Q8NHQ1 597 aa22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 C18orf8Q96DM3 657 aa22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K14Q99558 947 aa22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 REEP2Q9BRK0 252 aa22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ABCF3Q9NUQ8 709 aa22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 MYMKA6NI61 221 aa22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 CSF1RP07333 972 aa22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 STILQ15468 1287 aa22.33■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.33■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.33■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.33■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SNX19Q92543 992 aa22.33■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 IMPG1Q17R60 797 aa22.33■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms