RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 RASSF3Q86WH2 238 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SEC14L1Q92503 715 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 PTPRN2Q92932 1015 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SPATA16Q9BXB7 569 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 NDE1Q9NXR1 346 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ARMCX1Q9P291 453 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 PCDHA12Q9UN75 941 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 USP20Q9Y2K6 914 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 CYTH3O43739 400 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 TTC4O95801 387 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SPATA31D3P0C874 917 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 WDR4P57081 412 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SCFD1Q8WVM8 642 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 WDR60Q8WVS4 1066 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SPZ1Q9BXG8 430 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 FAM192AQ9GZU8 254 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SYNCQ9H7C4 482 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF232Q9UNY5 417 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 C2orf71A6NGG8 1288 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 PTGIRP43119 386 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 BPIFB4P59827 614 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 LIN52Q52LA3 116 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 PALB2Q86YC2 1186 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SAYSD1Q9NPB0 183 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SH3GLB2Q9NR46 395 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ARL8BQ9NVJ2 186 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 TMOD3Q9NYL9 352 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ECM29Q5VYK3 1845 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 GAS8O95995 478 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM49P0CI25 452 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM49CP0CI26 452 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 PLS3P13797 630 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 KCNQ4P56696 695 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 KDSRQ06136 332 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 C1orf146Q5VVC0 180 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 MFSD5Q6N075 450 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 NME8Q8N427 588 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 MAML1Q92585 1016 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 PHF12Q96QT6 1004 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SMYD3Q9H7B4 428 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 H3BRJ5 948 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 CETPP11597 493 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 LVRNQ6Q4G3 990 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SH3TC2Q8TF17 1288 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 TIPINQ9BVW5 301 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 BLOC1S6Q9UL45 172 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 BTNL10A8MVZ5 291 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 TBCAO75347 108 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ENO1P06733 434 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM253P0C7T8 217 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 T-ENOLP0DO92 83 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 STAT3P40763 770 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 CASP5P51878 434 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 DSG1Q02413 1049 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 CYP4A11Q02928 519 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 CHRNDQ07001 517 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 MTMR2Q13614 643 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ECM1Q16610 540 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SLFN11Q7Z7L1 901 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SFR1Q86XK3 245 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 THTPAQ9BU02 230 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 IKZF4Q9H2S9 585 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 GPCPD1Q9NPB8 672 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 NINJ2Q9NZG7 142 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 B2RBV5 119 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 CALUO43852 315 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 AKAP3O75969 853 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 TMCC1O94876 653 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 OR6B1O95007 311 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ATP6V1B1P15313 513 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 HSPA6P17066 643 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 AMPD1P23109 780 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SOX5P35711 763 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 GALK1P51570 392 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ARFIP2P53365 341 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 YARSP54577 528 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGAP24Q8N264 748 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 FAM136AQ96C01 138 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 OLFM3Q96PB7 478 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 MIPEPQ99797 713 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 BTBD10Q9BSF8 475 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 MXD3Q9BW11 206 aa12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms