RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 IRS2Q9Y4H2 1338 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 PPFIA2O75334 1257 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 CASP5P51878 434 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB16Q05516 673 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 C4orf19Q8IY42 314 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 OR2W6PQ8NHA6 318 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 HSD17B14Q9BPX1 270 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.96e-6■■■■■ 48.1
HERC3-201ENST00000264345 SENP1Q9P0U3 644 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 IFNAR2P48551 515 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 TFDP1Q14186 410 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 CENPUQ71F23 418 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 PALM2Q8IXS6 379 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 LRRC15Q8TF66 581 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 LRRIQ4A6NIV6 560 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 EML1O00423 815 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 GSTA1P08263 222 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 SLCO1A2P46721 670 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 RCOR2Q8IZ40 523 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 LRRC57Q8N9N7 239 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 RAPGEF5Q92565 580 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 GPRASP2Q96D09 838 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 GOLPH3Q9H4A6 298 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 TBX20Q9UMR3 447 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 TRPC6Q9Y210 931 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 VGLL3A8MV65 326 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 ASAP2O43150 1006 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 PSTPIP1O43586 416 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 CCDC6Q16204 474 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 SLFN11Q7Z7L1 901 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 ZHX2Q9Y6X8 837 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 RAD17O75943 681 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 ARP10275 920 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 GARTP22102 1010 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 MIGA2Q7L4E1 593 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 MSTO1Q9BUK6 570 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 PARVAQ9NVD7 372 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 CCT8L1PA6NM43 557 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 ACSL3O95573 720 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 CIAPIN1Q6FI81 312 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 TRIM42Q8IWZ5 723 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 OSGEPQ9NPF4 335 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 PCYOX1Q9UHG3 505 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 EXTL3O43909 919 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 SEC24CP53992 1094 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 HADHBP55084 474 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 SPARCL1Q14515 664 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 TMED2Q15363 201 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 TMEM35BQ8NCS4 154 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 TCP11Q8WWU5 503 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 SAAL1Q96ER3 474 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 FAM167AQ96KS9 214 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 FAM213AQ9BRX8 229 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 GABBR1Q9UBS5 961 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 MYH8P13535 1937 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 K7ERI5 159 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 TRAPPC3O43617 180 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 DCTN3O75935 186 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 NUDT17P0C025 328 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 TMEM191BP0C7N4 346 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 VPS41P49754 854 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 KSR1Q8IVT5 923 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 LMNTD2Q8IXW0 634 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 CNPY4Q8N129 248 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 AGBL3Q8NEM8 1001 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 SPIRE2Q8WWL2 714 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 SMAPO00193 183 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 TGFB1I1O43294 461 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 ITGA4P13612 1032 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 CD19P15391 556 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 POLD1P28340 1107 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 CAP2P40123 477 aa9.43□□□□□ -0.9
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