RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 PRUNE1Q86TP1 453 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
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PTPRB-201ENST00000261266 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 GOLGA8IPA6NC78 632 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 COBLO75128 1261 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 PRLRP16471 622 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 MED21Q13503 144 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRB-201ENST00000261266 HSPBP1Q9NZL4 362 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 HACD3Q9P035 362 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRB-201ENST00000261266 NBPF26B4DH59 902 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRB-201ENST00000261266 RASA4O43374 803 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRB-201ENST00000261266 Q4G0T1 1027 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 SWSAP1Q6NVH7 229 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRB-201ENST00000261266 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
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PTPRB-201ENST00000261266 SP110Q9HB58 689 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF484Q5JVG2 852 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRB-201ENST00000261266 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRB-201ENST00000261266 AKR1B1P15121 316 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRB-201ENST00000261266 COG1Q8WTW3 980 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 AIFM3Q96NN9 605 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 TTC36A6NLP5 189 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 KIF28PB7ZC32 967 aa9.54□□□□□ -0.88
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