RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 ECM1Q16610 540 aa6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 DYMQ7RTS9 669 aa6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 ERP44Q9BS26 406 aa6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 VCXQ9H320 206 aa6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 AMFRQ9UKV5 643 aa6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 GAP43P17677 238 aa6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 RCN1Q15293 331 aa6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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SGIP1-201ENST00000237247 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.74□□□□□ -1.33
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SGIP1-201ENST00000237247 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 FAM136AQ96C01 138 aa6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.74□□□□□ -1.33
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SGIP1-201ENST00000237247 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 TMEM260Q9NX78 707 aa6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 TIMM22Q9Y584 194 aa6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.74□□□□□ -1.33
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SGIP1-201ENST00000237247 PODXLO00592 558 aa6.73□□□□□ -1.33
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SGIP1-201ENST00000237247 CTNNA2P26232 953 aa6.73□□□□□ -1.33
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SGIP1-201ENST00000237247 STAT1P42224 750 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 PLS1Q14651 629 aa6.73□□□□□ -1.33
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SGIP1-201ENST00000237247 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF804AQ7Z570 1209 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 KDM1AO60341 852 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 PHF2O75151 1096 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 TCEA3O75764 348 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 EPS15P42566 896 aa6.73□□□□□ -1.33
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SGIP1-201ENST00000237247 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 CTAG1AP78358 180 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 KLC1Q07866 573 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF543Q08ER8 600 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 SPIDRQ14159 915 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 KIF22Q14807 665 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 TRADDQ15628 312 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 INAQ16352 499 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 CCDC63Q8NA47 563 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 NLRP3Q96P20 1036 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 STK33Q9BYT3 514 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.73□□□□□ -1.33
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SGIP1-201ENST00000237247 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 PMM2O15305 246 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 DAPK3O43293 454 aa6.73□□□□□ -1.33
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SGIP1-201ENST00000237247 ACADVLP49748 655 aa6.73□□□□□ -1.33
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SGIP1-201ENST00000237247 USP46P62068 366 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 MAPK7Q13164 816 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 TAF11Q15544 211 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 KRT71Q3SY84 523 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 ARSHQ5FYA8 562 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 POTEAQ6S8J7 498 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 GPBP1Q86WP2 473 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 CEP95Q96GE4 821 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-201ENST00000237247 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.73□□□□□ -1.33
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