RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235347.4

PRAMEF10-201, Transcript of PRAME family member 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF10, Length 1,525 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZPBP2Q6X784 338 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 TOP1MTQ969P6 601 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 CDT1Q9H211 546 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 GDAQ9Y2T3 454 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 IPPQ9Y573 584 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 MEIS3P2A8K0S8 358 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 ANKRD63C9JTQ0 380 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 TOM1L1O75674 476 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 GJB5O95377 273 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 FGFR1P11362 822 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 HOXD13P35453 343 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 RABGGTBP53611 331 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 PSMD2Q13200 908 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 MPZL3Q6UWV2 235 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZBTB33Q86T24 672 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 NELFCDQ8IXH7 590 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 RNF169Q8NCN4 708 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 CCDC112Q8NEF3 446 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF507Q8TCN5 953 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 SCFD1Q8WVM8 642 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 LPPQ93052 612 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 GSDMAQ96QA5 445 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 ACCSQ96QU6 501 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 RNF19AQ9NV58 838 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 HES2Q9Y543 173 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF623O75123 536 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 SERPINC1P01008 464 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 STAG3L1P0CL83 205 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 MCF2P10911 925 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 SKIP12755 728 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 GATMP50440 423 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 MCL1Q07820 350 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 SYCP1Q15431 976 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 BMT2Q1RMZ1 405 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 CEP120Q8N960 986 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 APOL6Q9BWW8 343 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 PDCL3Q9H2J4 239 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMEM206Q9H813 350 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 RMND1Q9NWS8 449 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 EXOC7Q9UPT5 735 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 TLL1O43897 1013 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 DGKIO75912 1065 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 EOMESO95936 686 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 MYOGP15173 224 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 PBX2P40425 430 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 RBM10P98175 930 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 LRIT3Q3SXY7 679 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 CEP135Q66GS9 1140 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMEM139Q8IV31 216 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 SYCP3Q8IZU3 236 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 PGBD4Q96DM1 585 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 YME1L1Q96TA2 773 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAMEF10-201ENST00000235347 TCHPQ9BT92 498 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms