RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CHRNB1P11230 501 aa18.42■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 RTP2Q5QGT7 225 aa18.42■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 TANGO2Q6ICL3 276 aa18.42■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 KSR1Q8IVT5 923 aa18.42■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 SPEM1Q8N4L4 309 aa18.42■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa18.42■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 DISC1Q9NRI5 854 aa18.42■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 MIOSQ9NXC5 875 aa18.42■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 ADAM28Q9UKQ2 775 aa18.42■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 POLIQ9UNA4 740 aa18.42■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa18.42■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 EPN2O95208 641 aa18.41■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 FCARP24071 287 aa18.41■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 MLH1P40692 756 aa18.41■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 SCNN1GP51170 649 aa18.41■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 FOXC1Q12948 553 aa18.41■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 TTC22Q5TAA0 569 aa18.41■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 FAM3CQ92520 227 aa18.41■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 ELSPBP1Q96BH3 223 aa18.41■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 NLRP4Q96MN2 994 aa18.41■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 GAD1Q99259 594 aa18.41■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 CLSTN3Q9BQT9 956 aa18.41■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 COLEC11Q9BWP8 271 aa18.41■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 UBN1Q9NPG3 1134 aa18.41■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 GDE1Q9NZC3 331 aa18.41■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 PCNX2A6NKB5 2137 aa18.41■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM150BA6NC51 233 aa18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 GIPC1O14908 333 aa18.4■□□□□ 0.54
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SPCS1-201ENST00000233025 DNM2P50570 870 aa18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 PTH1RQ03431 593 aa18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 SLC5A9Q2M3M2 681 aa18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 MTERF2Q49AM1 385 aa18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 PLA2G2CQ5R387 149 aa18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 CEP68Q76N32 757 aa18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 SLC7A14Q8TBB6 771 aa18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 LENG9Q96B70 501 aa18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 LOXL4Q96JB6 756 aa18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 ZFP42Q96MM3 310 aa18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 MTA3Q9BTC8 594 aa18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 ARID2Q68CP9 1835 aa18.39■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 ACACAQ13085 2346 aa18.39■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 ATG2BQ96BY7 2078 aa18.39■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 AXIN1O15169 862 aa18.39■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 NR1I2O75469 434 aa18.39■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 STBD1O95210 358 aa18.39■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 CALM1P0DP23 149 aa18.39■□□□□ 0.53
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SPCS1-201ENST00000233025 CALM3P0DP25 149 aa18.39■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 ITGA4P13612 1032 aa18.39■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 PTGDRQ13258 359 aa18.39■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 GRM2Q14416 872 aa18.39■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 MCRS1Q96EZ8 462 aa18.39■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 SH2D3AQ9BRG2 576 aa18.39■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 BRD9Q9H8M2 597 aa18.39■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 MINDY3Q9H8M7 445 aa18.39■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 IPPQ9Y573 584 aa18.39■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 PIAS3Q9Y6X2 628 aa18.39■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 SMCO2A6NFE2 343 aa18.38■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC69A6NI79 296 aa18.38■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 ADAM12O43184 909 aa18.38■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 HOXC13P31276 330 aa18.38■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 RAP1GAPP47736 663 aa18.38■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa18.38■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 NFXL1Q6ZNB6 911 aa18.38■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 MAP4K3Q8IVH8 894 aa18.38■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 CNNM3Q8NE01 707 aa18.38■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 PIK3R5Q8WYR1 880 aa18.38■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 SMOC1Q9H4F8 434 aa18.38■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 TRPV5Q9NQA5 729 aa18.38■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 C2orf42Q9NWW7 574 aa18.38■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa18.38■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 PRC1O43663 620 aa18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 MAFO75444 373 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 CEBPBP17676 345 aa18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 HOXA6P31267 233 aa18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 PSMD5Q16401 504 aa18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 PRR16Q569H4 304 aa18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 RNF43Q68DV7 783 aa18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 CASC1Q6TDU7 716 aa18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 WDR5BQ86VZ2 330 aa18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 FANCBQ8NB91 859 aa18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 GSTCDQ8NEC7 633 aa18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
SPCS1-201ENST00000233025 IRF7Q92985 503 aa18.37■□□□□ 0.53
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