RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lamtor4Q8CF66 99 aa31.07■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kct2Q8K201 259 aa31.07■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rnf103Q9R1W3 683 aa31.07■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tll2Q9WVM6 1012 aa31.07■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ndufs6P52503 116 aa31.06■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Oaz1P54369 227 aa31.06■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Carmil2Q3V3V9 1296 aa31.06■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppp1r1bQ60829 194 aa31.06■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AsphQ8BSY0 741 aa31.06■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Taf2Q8C176 1104 aa31.06■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Leg1Q8C6C9 337 aa31.06■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Phldb2Q8K1N2 1249 aa31.06■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 TraipQ8VIG6 470 aa31.06■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Asic2Q925H0 512 aa31.06■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Col5a3Q9JLI2 1739 aa31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Igkv10-96A0A140T8M1 115 aa31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Xrcc6P23475 608 aa31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Myo1fP70248 1099 aa31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppm1jQ149T7 507 aa31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Phactr1Q2M3X8 580 aa31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NntQ61941 1086 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stxbp5Q8K400 1152 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 DcpsQ9DAR7 338 aa31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rnf25Q9QZR0 456 aa31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Wnt8bQ9WUD6 350 aa31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc121E9Q6D3 323 aa31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Aimp1P31230 310 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trim72Q1XH17 477 aa31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gas8Q60779 478 aa31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mettl25Q6NXH8 597 aa31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppp2r2cQ8BG02 447 aa31.05■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Scgb2b11A0A087WR49 112 aa31.04■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm13941A2AJ38 245 aa31.04■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tatdn2B7ZNL9 783 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn2r17E9PYF5 849 aa31.04■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 P01644 108 aa31.04■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 P01645 108 aa31.04■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 P01646 108 aa31.04■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 P01647 108 aa31.04■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 TdgP56581 421 aa31.04■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ptgs2Q05769 604 aa31.04■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hspa4Q61316 841 aa31.04■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mrps31Q61733 384 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Podnl1Q6P3Y9 559 aa31.04■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rftn2Q8CHX7 500 aa31.04■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Drap1Q9D6N5 205 aa31.04■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dkc1Q9ESX5 509 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm45261A0A1B0GSP6 197 aa31.03■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Wdr72D3YYM4 1114 aa31.03■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm4788E9Q8B5 879 aa31.03■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Btg4O70552 250 aa31.03■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tnnc2P20801 160 aa31.03■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Acvr2bP27040 536 aa31.03■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gse1Q3U3C9 1213 aa31.03■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 RetsatQ64FW2 609 aa31.03■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trim65Q8BFW4 522 aa31.03■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Iqcb1Q8BP00 598 aa31.03■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gtpbp10Q8K013 366 aa31.03■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Smc1bQ920F6 1248 aa31.03■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tlr3Q99MB1 905 aa31.03■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam217aQ9D9W6 419 aa31.03■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Psma7Q9Z2U0 248 aa31.03■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Syngap1F6SEU4 1340 aa31.03■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PurbO35295 324 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pik3caP42337 1068 aa31.02■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Q3TTJ4 293 aa31.02■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Snx25Q3ZT31 840 aa31.02■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zcchc2Q69ZB8 1166 aa31.02■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Armcx2Q6A058 784 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 B3glctQ8BHT6 489 aa31.02■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pcdha9Q91Y11 979 aa31.02■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 B4galt4Q9JJ04 344 aa31.02■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trim12cD3Z3L3 497 aa31.01■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ano7Q14AT5 859 aa31.01■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 SpoplQ2M2N2 392 aa31.01■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmtc1Q3UV71 942 aa31.01■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Usp38Q8BW70 1042 aa31.01■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rint1Q8BZ36 792 aa31.01■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Eif3cQ8R1B4 911 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dnajc12Q9R022 198 aa31.01■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arih2Q9Z1K6 492 aa31.01■■■□□ 2.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Osbpl7A2A716 963 aa31■■■□□ 2.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm28042B7ZCM9 1014 aa31■■■□□ 2.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pola2P33611 600 aa31■■■□□ 2.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Skap1Q3UUV5 355 aa31■■■□□ 2.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ItgaeQ60677 1167 aa31■■■□□ 2.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fhod1Q6P9Q4 1197 aa31■■■□□ 2.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rassf10Q8BL43 508 aa31■■■□□ 2.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zswim3Q8CFL8 695 aa31■■■□□ 2.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 YarsQ91WQ3 528 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trpm5Q9JJH7 1158 aa31■■■□□ 2.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Map2k5Q9WVS7 448 aa31■■■□□ 2.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ifnar1P33896 590 aa31■■■□□ 2.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stat4P42228 749 aa31■■■□□ 2.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Echdc2Q3TLP5 296 aa31■■■□□ 2.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mrgprb8Q7TN51 330 aa31■■■□□ 2.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pkn2Q8BWW9 983 aa31■■■□□ 2.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hgh1Q8C3I8 393 aa31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.8 ms