RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp37Q8C0R0 979 aa28.08■■■□□ 2.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rhobtb2Q91V93 728 aa28.08■■■□□ 2.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RpainQ9CWY9 219 aa28.08■■■□□ 2.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnajc18Q9CZJ9 357 aa28.08■■■□□ 2.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt71Q9R0H5 524 aa28.08■■■□□ 2.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tex35Q14BK3 207 aa28.08■■■□□ 2.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 DaglbQ91WC9 669 aa28.08■■■□□ 2.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rrm1P07742 792 aa28.07■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Chmp6P0C0A3 200 aa28.07■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 H2-OaQ9QWV1 250 aa28.07■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 506 aa28.07■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zscan4-ps2A0A1C7CYU6 506 aa28.07■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bpifb9bA2AJD1 591 aa28.07■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Has3O08650 554 aa28.07■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 P01734 135 aa28.07■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AfpP02772 605 aa28.07■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Art2aP17981 287 aa28.07■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bpifb9aQ80XI7 591 aa28.07■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 HlcsQ920N2 722 aa28.07■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc91Q9D8L5 442 aa28.07■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mipol1Q9D9F8 279 aa28.07■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Proca1B0QZF7 307 aa28.06■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AunipE9Q6Z5 340 aa28.06■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pitpnm1O35954 1243 aa28.06■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rrp36Q3UFY0 244 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Odr4Q4PJX1 447 aa28.06■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zbtb17Q60821 794 aa28.06■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spire2Q8K1S6 718 aa28.06■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gyg1Q9R062 333 aa28.06■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Leg1Q8C6C9 337 aa28.06■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fkbp6Q91XW8 327 aa28.06■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa28.06■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mmp20P57748 482 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Capn13Q3UW68 665 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyfip1Q7TMB8 1253 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 A430089I19RikQ8C9W1 407 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pgap3A2A559 320 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Neurl1bQ0MW30 546 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rmdn3Q3UJU9 470 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vps41Q5KU39 853 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gga2Q6P5E6 603 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ntrk3Q6VNS1 825 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rccd1Q8BTU7 377 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam133bQ9CVI2 245 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olig1Q9JKN5 260 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim55G3X8Y1 545 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ErfeQ6PGN1 340 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Actl9Q8CG27 415 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gnl3Q8CI11 538 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mill1Q8HWE7 395 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ankef1Q9D2J7 775 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm3182K7N6T8 263 aa28.04■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PrkceP16054 737 aa28.04■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Efl1Q8C0D5 1127 aa28.04■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Polr3fQ921X6 316 aa28.04■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tlr3Q99MB1 905 aa28.04■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sf3a3Q9D554 501 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tacc3Q9JJ11 631 aa28.04■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RptorQ8K4Q0 1335 aa28.04■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm382B1AXN3 1250 aa28.04■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Enoph1Q8BGB7 257 aa28.04■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hook3Q8BUK6 718 aa28.04■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Btbd6Q8K2J9 488 aa28.03■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tti1Q91V83 1085 aa28.03■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ces1fQ91WU0 561 aa28.03■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ggt5Q9Z2A9 573 aa28.03■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bcat1P24288 386 aa28.03■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 VegfaQ00731 214 aa28.03■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmprss11eQ5S248 423 aa28.03■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tfap2bQ61313 459 aa28.03■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Efcab14Q8BGQ6 484 aa28.03■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AfmO89020 608 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif5cP28738 956 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spink5Q148R4 1017 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lman1lQ8VCD3 505 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Xpo6Q924Z6 1125 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zcchc8Q9CYA6 709 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tbc1d16A2ABG4 766 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prdm15E9Q8T2 1174 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Casp7P97864 303 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mapk4Q6P5G0 583 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gpr156Q6PCP7 798 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rnf139Q7TMV1 668 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kbtbd3Q8BHI4 607 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Wrap53Q8VC51 532 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnajc28Q8VCE1 385 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mms22lB1AUR6 1238 aa28.01■■■□□ 2.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spata31d1dE9Q5W2 1247 aa28.01■■■□□ 2.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 UrosP51163 265 aa28.01■■■□□ 2.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Actr2P61161 394 aa28.01■■■□□ 2.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bpifb5Q3UQ05 490 aa28.01■■■□□ 2.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam92bQ3V2J0 292 aa28.01■■■□□ 2.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ythdf3Q8BYK6 585 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rsad2Q8CBB9 362 aa28.01■■■□□ 2.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 C8aQ8K182 587 aa28.01■■■□□ 2.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scrn2Q8VCA8 425 aa28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34 ms