RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 DRP2Q13474 957 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 MAPK6Q16659 721 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 ARHGAP44Q17R89 818 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 NENFQ9UMX5 172 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 DLATP10515 647 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 PRLRP16471 622 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 ACVR2BQ13705 512 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 SV2AQ7L0J3 742 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 RNF149Q8NC42 400 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 GOLGA1Q92805 767 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 NT5C1BQ96P26 610 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 TSKSQ9UJT2 592 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 CLDN3O15551 220 aa24.23■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 MSCO60682 206 aa24.23■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 TOM1L1O75674 476 aa24.23■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 ELF2Q15723 593 aa24.23■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa24.23■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.23■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 AFG1LQ8WV93 481 aa24.23■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 NFKBIZQ9BYH8 718 aa24.23■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 MOCS3O95396 460 aa24.22■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 RGMBQ6NW40 437 aa24.22■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa24.22■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 ARHGEF19Q8IW93 802 aa24.22■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.22■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 SLC30A5Q8TAD4 765 aa24.22■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa24.22■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.475e-10■■■□□ 17.9
USP36-218ENST00000590546 PRKCBP05771 671 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 H2AFZP0C0S5 128 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 AP3M2P53677 418 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 CHMP4BP1P59074 171 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 MORN1Q5T089 497 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 H2AFVQ71UI9 128 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 RHPN2Q8IUC4 686 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 LRRN4CLQ8ND94 238 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 RABGGTAQ92696 567 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 SYT11Q9BT88 431 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 RNPEPQ9H4A4 650 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 CPA4Q9UI42 421 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 V9GYY5 206 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 CTAGE15A4D2H0 777 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 ENC1O14682 589 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 C22orf31O95567 290 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 CTAGE8P0CG41 777 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 INSRRP14616 1297 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 TNFAIP3P21580 790 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 RBM10P98175 930 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 MAP2K5Q13163 448 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 GRM1Q13255 1194 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 CTAGE6Q86UF2 777 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 CTAGE4Q8IX94 777 aa24.21■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 ACKR2O00590 384 aa24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 HOXC6P09630 235 aa24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 TNNI1P19237 187 aa24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 KLRC1P26715 233 aa24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 TMOD1P28289 359 aa24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 SURF1Q15526 300 aa24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 ZACNQ401N2 412 aa24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 SAPCD2Q86UD0 394 aa24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 FAM71AQ8IYT1 594 aa24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 PPM1KQ8N3J5 372 aa24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 METTL13Q8N6R0 699 aa24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 TAS1R2Q8TE23 839 aa24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 SEMA4DQ92854 862 aa24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 LRRN2O75325 713 aa24.19■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 ACOT2P49753 483 aa24.19■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 PTENP60484 403 aa24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms