RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 ABI1Q8IZP0 508 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4D-208ENST00000588667 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4D-208ENST00000588667 SPATA20Q8TB22 786 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4D-208ENST00000588667 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4D-208ENST00000588667 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ATG4D-208ENST00000588667 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4D-208ENST00000588667 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ATG4D-208ENST00000588667 TBX20Q9UMR3 447 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4D-208ENST00000588667 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4D-208ENST00000588667 IPPQ9Y573 584 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4D-208ENST00000588667 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 BIN1O00499 593 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 NPTXRO95502 500 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF165P49910 485 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 GTF2BQ00403 316 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 COASYQ13057 564 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 UVSSAQ2YD98 709 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 HACE1Q8IYU2 909 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 FIBCD1Q8N539 461 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 DPYDQ12882 1025 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 ZPBP2Q6X784 338 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 LPPQ93052 612 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 HVCN1Q96D96 273 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 GSDMAQ96QA5 445 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 CASP1P29466 404 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 CUL4BQ13620 913 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 UNC13DQ70J99 1090 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 PPP1R37O75864 691 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 ITGA4P13612 1032 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 PROZP22891 400 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 ALCAMQ13740 583 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 HELQQ8TDG4 1101 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 CASD1Q96PB1 797 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 RSAD1Q9HA92 442 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 HES2Q9Y543 173 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 TOM1L1O75674 476 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 GCNT3O95395 438 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 PIGRP01833 764 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 Q7L0L9 218 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 LRRC43Q8N309 656 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 DEFB123Q8N688 67 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 BICD1Q96G01 975 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 SAMD11Q96NU1 681 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 STRA6Q9BX79 667 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 CBX8Q9HC52 389 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 CITO14578 2027 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 ERVK-21P61565 698 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 EHHADHQ08426 723 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 CDT1Q9H211 546 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 RMND1Q9NWS8 449 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 ABLIM1O14639 778 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 OFD1O75665 1012 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 LINC00271P0C7V0 271 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 LIG4P49917 911 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 CASP5P51878 434 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 MORC3Q14149 939 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 ISM2Q6H9L7 571 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 SPRED2Q7Z698 418 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 FAM161BQ96MY7 647 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 TCHPQ9BT92 498 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms