RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584760.1

SREBF1-223, Transcript of sterol regulatory element binding transcription factor 1, human

TSL 2

Gene SREBF1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SREBF1-223	ENST00000584760	RNF39	Q9H2S5	420 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	CLIC4	Q9Y696	253 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	CIT	O14578	2027 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ACKR2	O00590	384 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	STX6	O43752	255 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	NPTXR	O95502	500 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	PRKCB	P05771	671 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	GUCY2C	P25092	1073 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	MLH1	P40692	756 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	NPTX2	P47972	431 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	EFNA5	P52803	228 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	HSCB	Q8IWL3	235 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ASIC4	Q96FT7	647 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	DRC1	Q96MC2	740 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	PLIN2	Q99541	437 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	TCF25	Q9BQ70	676 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	TRIO	O75962	3097 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	CARNS1	A5YM72	827 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ARL5C	A6NH57	179 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760		H0Y858	1186 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	N4BP3	O15049	544 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	DDHD2	O94830	711 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	POMC	P01189	267 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	GALT	P07902	379 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	PLA2G4B	P0C869	781 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	SLC11A1	P49279	550 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	PEX3	P56589	373 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	KRT17	Q04695	432 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ZBTB33	Q86T24	672 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	HACE1	Q8IYU2	909 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	SUSD6	Q92537	303 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	TMEM169	Q96HH4	297 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	IGSF21	Q96ID5	467 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ZFP42	Q96MM3	310 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	GAD1	Q99259	594 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	APOL6	Q9BWW8	343 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	APOL5	Q9BWW9	433 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	KCND2	Q9NZV8	630 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	USP20	Q9Y2K6	914 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	UBA7	P41226	1012 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	DSC1	Q08554	894 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	PTPN21	Q16825	1174 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	DUSP6	Q16828	381 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	USP28	Q96RU2	1077 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	GBP3	Q9H0R5	595 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	CCDC169	A6NNP5	214 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	HIDE1	A8MVS5	230 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	LIG1	P18858	919 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	PLCG1	P19174	1290 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	AKAP5	P24588	427 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	SCNN1G	P51170	649 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ARSH	Q5FYA8	562 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	CALML4	Q96GE6	196 aa		14.65	□□□□□ -0.06

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