RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 EPHA5P54756 1037 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 PTH1RQ03431 593 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 PKP1Q13835 747 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 RAB33AQ14088 237 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 NTRK3Q16288 839 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 GORABQ5T7V8 394 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 KCNT2Q6UVM3 1135 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 KCTD1Q719H9 257 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 NEUROD6Q96NK8 337 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 TRIM55Q9BYV6 548 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 SIL1Q9H173 461 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 PAG1Q9NWQ8 432 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 RBPJLQ9UBG7 517 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 LAMB4A4D0S4 1761 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 PALLDQ8WX93 1383 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 JCADQ9P266 1359 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 MED23Q9ULK4 1368 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 WDR19Q8NEZ3 1342 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 CDHR2Q9BYE9 1310 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 MEGF6O75095 1541 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 SYCE3A1L190 88 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 ERVV-1B6SEH8 477 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 H3BQV1 296 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 GPR42O15529 346 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 B4GALT4O60513 344 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 KNG1P01042 644 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 CSF1RP07333 972 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 TPM2P07951 284 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC192P0DO97 292 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 COL6A2P12110 1019 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 SKIDA1Q1XH10 827 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 TAF7LQ5H9L4 462 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 CD276Q5ZPR3 534 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 Q6ZUG5 572 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC83Q8IWF9 413 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 REXO1L1PQ8IX06 675 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 DNERQ8NFT8 737 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 NUDT11Q96G61 164 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 KCNJ15Q99712 375 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 ISCA1Q9BUE6 129 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 PANK2Q9BZ23 570 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 KLC2Q9H0B6 622 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 CD248Q9HCU0 757 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 IGSF5Q9NSI5 407 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 ZFP69BQ9UJL9 534 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 MTMR6Q9Y217 621 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 EXOC5O00471 708 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 PFKFB2O60825 505 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 IGSF3O75054 1194 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 PTMAP06454 111 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 CKMP06732 381 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 SELENOPP49908 381 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 EVCP57679 992 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 TRDNQ13061 729 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 ICAM4Q14773 271 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 ME3Q16798 604 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 ADCK5Q3MIX3 580 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 EPHA10Q5JZY3 1008 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRM-215ENST00000583289 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 ATG9AQ7Z3C6 839 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 FAM227BQ96M60 508 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 AGXT2Q9BYV1 514 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRM-215ENST00000583289 SEC61A2Q9H9S3 476 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 KCND1Q9NSA2 647 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 SRRDQ9UH36 339 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 USP25Q9UHP3 1055 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 TPCN1Q9ULQ1 816 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 A0A0D9SFI3 127 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 A0A1B0GUL7 405 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF839A8K0R7 811 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRM-215ENST00000583289 PATE3B3GLJ2 98 aa5.23□□□□□ -1.57
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