RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579814.1

LIMD2-208, Transcript of LIM domain containing 2, human

TSL 2

Gene LIMD2, Length 709 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIMD2-208	ENST00000579814	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		28.86	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	HIDE1	A8MVS5	230 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	NRP1	O14786	923 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	B4GALT3	O60512	393 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	TBX10	O75333	385 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	PLS3	P13797	630 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	CA8	P35219	290 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	KLK14	Q9P0G3	267 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	CD207	Q9UJ71	328 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	IL9	P15248	144 aa		28.84	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	OR1G1	P47890	313 aa		28.84	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	CLUL1	Q15846	466 aa		28.84	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		28.84	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		28.84	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	SNTG2	Q9NY99	539 aa		28.84	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		28.84	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		28.84	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	SLC16A4	O15374	487 aa		28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	EDN1	P05305	212 aa		28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	PLCG1	P19174	1290 aa		28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	DSC1	Q08554	894 aa		28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	GIT2	Q14161	759 aa		28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	GPBP1	Q86WP2	473 aa		28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	USP28	Q96RU2	1077 aa		28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	ZBP1	Q9H171	429 aa		28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	CLEC1B	Q9P126	229 aa		28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
LIMD2-208	ENST00000579814	CTSA	P10619	480 aa		28.82	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	GRIK3	Q13003	919 aa		28.82	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	SLC39A14	Q15043	492 aa		28.82	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	ARSH	Q5FYA8	562 aa		28.82	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	SPECC1	Q5M775	1068 aa		28.82	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	RAD54L	Q92698	747 aa		28.82	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	EPSTI1	Q96J88	318 aa		28.82	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		28.82	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		28.82	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		28.82	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		28.82	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		28.81	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	GLP2R	O95838	553 aa		28.81	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	DDIT3	P35638	169 aa		28.81	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	TXLNA	P40222	546 aa		28.81	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	STRN3	Q13033	797 aa		28.81	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814		H0YCG3	227 aa		28.8	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	MBTPS2	O43462	519 aa		28.8	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	RECQL4	O94761	1208 aa		28.8	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	COASY	Q13057	564 aa		28.8	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	MCM6	Q14566	821 aa		28.8	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		28.8	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		28.8	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	CLIC6	Q96NY7	704 aa		28.8	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	TCHP	Q9BT92	498 aa		28.8	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	IRAK3	Q9Y616	596 aa		28.8	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	USP49	Q70CQ1	688 aa		28.79	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		28.79	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		28.79	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		28.79	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	LRRC15	Q8TF66	581 aa		28.79	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	GDA	Q9Y2T3	454 aa		28.79	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	FAM13A	O94988	1023 aa		28.78	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	STK38	Q15208	465 aa		28.78	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		28.78	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		28.78	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	REEP2	Q9BRK0	252 aa		28.78	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		28.78	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		28.78	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	MARCH5	Q9NX47	278 aa		28.78	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		28.78	■■■□□ 2.2
LIMD2-208	ENST00000579814	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		28.77	■■■□□ 2.2

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