RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HVCN1Q96D96 273 aa26.03■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RABEP2Q9H5N1 569 aa26.03■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NENFQ9UMX5 172 aa26.03■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EBAG9O00559 213 aa26.03■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CPP00450 1065 aa26.03■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CNGA1P29973 690 aa26.03■■□□□ 1.76
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDCLQ13371 301 aa26.02■■□□□ 1.76
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CBWD2Q8IUF1 395 aa26.02■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IFT74Q96LB3 600 aa26.02■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 APEX2Q9UBZ4 518 aa26.02■■□□□ 1.76
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A6NNZ2 444 aa26.02■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 F8VZ95 297 aa26.02■■□□□ 1.76
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPR162Q16538 588 aa26.02■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TUBB8Q3ZCM7 444 aa26.02■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KDM7AQ6ZMT4 941 aa26.02■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCFD2Q8WU76 684 aa26.02■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM107BQ9H098 131 aa26.02■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF408Q9H9D4 720 aa26.02■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCNK3O14649 394 aa26.01■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LY6KQ17RY6 165 aa26.01■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C1orf220Q5T0J3 134 aa26.01■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPAT2Q6NUI2 795 aa26.01■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM143Q96AN5 459 aa26.01■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STK33Q9BYT3 514 aa26.01■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GOLPH3Q9H4A6 298 aa26.01■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM169AQ9Y6X4 670 aa26.01■■□□□ 1.75
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TAF4BQ92750 862 aa26■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EVI5O60447 810 aa26■■□□□ 1.75
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RTP1P59025 263 aa26■■□□□ 1.75
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NEDD9Q14511 834 aa26■■□□□ 1.75
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BICD1Q96G01 975 aa26■■□□□ 1.75
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRRN2O75325 713 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP1A2P50993 1020 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CETN1Q12798 172 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCTD2Q14681 263 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa25.99■■□□□ 1.75
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ISCUQ9H1K1 167 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EFCC1Q9HA90 598 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRRC37A2A6NM11 1700 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP8B3O60423 1300 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAPK13O15264 365 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC127Q96BQ5 260 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FGD4Q96M96 766 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPR88Q9GZN0 384 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VPS36Q86VN1 386 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARIH2O95376 493 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 POTEJP0CG39 1038 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MXI1P50539 228 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNAPC2Q13487 334 aa25.98■■□□□ 1.75
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