RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 KRT79Q5XKE5 535 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 CYP26C1Q6V0L0 522 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 HFE2Q6ZVN8 426 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 GPR65Q8IYL9 337 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 UBALD2Q8IYN6 164 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 AUTS2Q8WXX7 1259 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 FBXL18Q96ME1 805 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 KLHL5Q96PQ7 755 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 FZD8Q9H461 694 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 KCNG1Q9UIX4 513 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 GLUD2P49448 558 aa18.35■□□□□ 0.53
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SPNS1-211ENST00000568829 MTMR3Q13615 1198 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 POTEGQ6S5H5 508 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 SLC22A17Q8WUG5 538 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 RNF39Q9H2S5 420 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 DNM3Q9UQ16 869 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 HES2Q9Y543 173 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 ACKR2O00590 384 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 EPCAMP16422 314 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 MCM2P49736 904 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 CLCN4P51793 760 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 USP41Q3LFD5 358 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 DTHD1Q6ZMT9 781 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 OTOP3Q7RTS5 596 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 KCTD17Q8N5Z5 321 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 HDAC7Q8WUI4 952 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 POMKQ9H5K3 350 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 GPRC5CQ9NQ84 441 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 SORCS3Q9UPU3 1222 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 ARID2Q68CP9 1835 aa18.33■□□□□ 0.53
SPNS1-211ENST00000568829 A0A087WWV3 80 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 C2CD2LO14523 706 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 B4GALT5O43286 388 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 TADA2AO75478 443 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 GLUD1P00367 558 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 PRKCBP05771 671 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 CNPP09543 421 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 AKAP5P24588 427 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 PRPHP41219 470 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 RILPL1Q5EBL4 403 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC149Q6ZUS6 474 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 SNX29Q8TEQ0 813 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 STAMQ92783 540 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 ZFP42Q96MM3 310 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 BHMT2Q9H2M3 363 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 KIAA1024Q9UPX6 916 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 103.4
SPNS1-211ENST00000568829 H3BQV1 296 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 LILRB3O75022 631 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 THP07101 528 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 DSG1Q02413 1049 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 PTGDRQ13258 359 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 TUSC3Q13454 348 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 C8orf34Q49A92 452 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 MCTP1Q6DN14 999 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 PDXDC1Q6P996 788 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 TMC5Q6UXY8 1006 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 GPR149Q86SP6 731 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 FBXL6Q8N531 539 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 DRC1Q96MC2 740 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 TIPINQ9BVW5 301 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 MARCH5Q9NX47 278 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 ADAM28Q9UKQ2 775 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 C5orf42Q9H799 3197 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 K7ERI5 159 aa18.31■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 B4GALT3O60512 393 aa18.31■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 LIG1P18858 919 aa18.31■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 SP100P23497 879 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 FUT10Q6P4F1 479 aa18.31■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 IGSF22Q8N9C0 903 aa18.31■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 KREMEN2Q8NCW0 462 aa18.31■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 VN1R3Q9BXE9 311 aa18.31■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa18.31■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 C17orf75Q9HAS0 396 aa18.31■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 RXFP1Q9HBX9 757 aa18.31■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 C2CD4DB7Z1M9 353 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 TEX28O15482 410 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 NUBP1P53384 320 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-211ENST00000568829 KIAA0319Q5VV43 1072 aa18.3■□□□□ 0.52
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