RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.36■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 HSPA6P17066 643 aa22.36■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 SLC9A1P19634 815 aa22.36■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 MXI1P50539 228 aa22.36■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 MCL1Q07820 350 aa22.36■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 PSMD6Q15008 389 aa22.36■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.36■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 GANQ9H2C0 597 aa22.36■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.36■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 OGTO15294 1046 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 TREHO43280 583 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 B4GALT5O43286 388 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 NOL4O94818 638 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 ERLIN2O94905 339 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 HOXC8P31273 242 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 GRK4P32298 578 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 GTF2H1P32780 548 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 GCLMP48507 274 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 ACOT2P49753 483 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 PPP3CAQ08209 521 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 PDXDC1Q6P996 788 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 RRAGAQ7L523 313 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 RNF180Q86T96 592 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 FNBP1Q96RU3 617 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 TRIM17Q9Y577 477 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 ASGR1P07306 291 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 ACTN1P12814 892 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 PROZP22891 400 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 HIC1Q14526 733 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 KCNA10Q16322 511 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 KIZQ2M2Z5 673 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 TSKSQ9UJT2 592 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.35■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.34■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 PMM2O15305 246 aa22.34■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 CCP110O43303 1012 aa22.34■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.34■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.34■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 NME8Q8N427 588 aa22.34■■□□□ 1.17
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CTU2-208ENST00000566637 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.34■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 LRRC53A6NM62 1247 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 ABLIM1O14639 778 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 IQCF3P0C7M6 154 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 MEA1Q16626 185 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 AMHR2Q16671 573 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 KRT39Q6A163 491 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.33■■□□□ 1.17
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CTU2-208ENST00000566637 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 GINS2Q9Y248 185 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-208ENST00000566637 GPR32O75388 356 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CABYRO75952 493 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 UCHL3P15374 230 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 APBA1Q02410 837 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 SIX2Q9NPC8 291 aa22.32■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 TSPAN1O60635 241 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 MCF2P10911 925 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
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