RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDT1Q9H211 546 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 RSAD1Q9HA92 442 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABLIM1O14639 778 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLRC4O43908 158 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 NR1I2O75469 434 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 OFD1O75665 1012 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 PROZP22891 400 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABCD1P33897 745 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNA1Q09470 495 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 SNTG2Q9NY99 539 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 TOM1L1O75674 476 aa22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 LINC00271P0C7V0 271 aa22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 LIG4P49917 911 aa22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERVK-21P61565 698 aa22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 EHHADHQ08426 723 aa22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 HACE1Q8IYU2 909 aa22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLK14Q9P0G3 267 aa22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 PARP2Q9UGN5 583 aa22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYL1P05976 194 aa22.95■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.95■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.95■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP120Q8N960 986 aa22.95■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 HVCN1Q96D96 273 aa22.95■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 GAD1Q99259 594 aa22.95■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.95■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.95■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 GDAQ9Y2T3 454 aa22.95■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 EPOPA6NHQ4 379 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 TISP43B9A030 160 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 RFXAPO00287 272 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLDN3O15551 220 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 PIGRP01833 764 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 MLH1P40692 756 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 OSTNP61366 133 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBE2HP62256 183 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 KANK3Q6NY19 840 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM192Q8IY95 271 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC43Q8N309 656 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZFP42Q96MM3 310 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACCSQ96QU6 501 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 CWH43Q9H720 699 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRANK1O15050 2925 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIP11Q15643 1979 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARL5CA6NH57 179 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 MCF2P10911 925 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 DPYDQ12882 1025 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 ALCAMQ13740 583 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 EPC2Q52LR7 807 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 RECQL4O94761 1208 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 POMCP01189 267 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTNNB1P35222 781 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 MCL1Q07820 350 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 PNOCQ13519 176 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 POSTNQ15063 836 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 SEZ6Q53EL9 994 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 URGCPQ8TCY9 931 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 EXOC1Q9NV70 894 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 MIOSQ9NXC5 875 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 BMPR1AP36894 532 aa22.92■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.92■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.92■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 TIGD1Q96MW7 591 aa22.92■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.92■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.92■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 CITO14578 2027 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms