RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	B3GALT6	Q96L58	329 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	CASD1	Q96PB1	797 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	FZD8	Q9H461	694 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PARP2	Q9UGN5	583 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	NR1I2	O75469	434 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	DDHD2	O94830	711 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC34A2	O95436	690 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SCNN1G	P51170	649 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	EPC2	Q52LR7	807 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	KIFAP3	Q92845	792 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	TCHP	Q9BT92	498 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	GRM6	O15303	877 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ASAP2	O43150	1006 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	LPXN	O60711	386 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	CTNNB1	P35222	781 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	BCAR1	P56945	870 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ASIC1	P78348	528 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ADAL	Q6DHV7	355 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PAGE5	Q96GU1	130 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	DRC1	Q96MC2	740 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PARVG	Q9HBI0	331 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PANK4	Q9NVE7	773 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	USP34	Q70CQ2	3546 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A1B0GUA9	196 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	GCNT3	O95395	438 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MUT	P22033	750 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	IRS1	P35568	1242 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SYK	P43405	635 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PNOC	Q13519	176 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	BICD1	Q96G01	975 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	TRIM9	Q9C026	710 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ARL5C	A6NH57	179 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF202	O95125	648 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	CMA1	P23946	247 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ACOT2	P49753	483 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	GUCY2F	P51841	1108 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM189B	P81408	668 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	COASY	Q13057	564 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	CAMK4	Q16566	473 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	NOTUM	Q6P988	496 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ABI1	Q8IZP0	508 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	FIBCD1	Q8N539	461 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM212A	Q96EL1	285 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	CWH43	Q9H720	699 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	HPSE	Q9Y251	543 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ACKR2	O00590	384 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PER2	O15055	1255 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	RECQL4	O94761	1208 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ITGB1	P05556	798 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	HOXD13	P35453	343 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	WNT7B	P56706	349 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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