RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FEZF2Q8TBJ5 459 aa21.54■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CPB2Q96IY4 423 aa21.54■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.54■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM86C1Q9NVL1 165 aa21.54■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GIT1Q9Y2X7 761 aa21.54■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MLH1P40692 756 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GUCY1B3Q02153 619 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TDGQ13569 410 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AMHR2Q16671 573 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM105Q8N8V8 129 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MIOSQ9NXC5 875 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HES2Q9Y543 173 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TEX28O15482 410 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C1RP00736 705 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GLUD2P49448 558 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCNN1GP51170 649 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CAPSQ13938 189 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZFP42Q96MM3 310 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NEMFO60524 1076 aa21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GFRA3O60609 400 aa21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GLUD1P00367 558 aa21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GLRA2P23416 452 aa21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TXKP42681 527 aa21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RARRES1P49788 294 aa21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DSG1Q02413 1049 aa21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MTMR9Q96QG7 549 aa21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNK12Q9HB15 430 aa21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHST7Q9NS84 486 aa21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CFAP54Q96N23 3096 aa21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1B0GUA9 196 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PROB1E7EW31 1015 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR65Q8IYL9 337 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 APOL6Q9BWW8 343 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STAMQ92783 540 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DUSP12Q9UNI6 340 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYO15AQ9UKN7 3530 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 H3BQV1 296 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 B4GALT5O43286 388 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP2B1P20020 1258 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AKAP5P24588 427 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP41Q3LFD5 358 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 F8W810 466 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PAPLNO95428 1278 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPTXRO95502 500 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GJB2P29033 226 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAPPC10P48553 1259 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GRIK3Q13003 919 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FLCNQ8NFG4 579 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FNIP2Q9P278 1114 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PARP2Q9UGN5 583 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DENND4AQ7Z401 1863 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARID2Q68CP9 1835 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A087WWV3 80 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WNT7AO00755 349 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FUT10Q6P4F1 479 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PALB2Q86YC2 1186 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NXPE3Q969Y0 559 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms