RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	PARP2	Q9UGN5	583 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	MYMK	A6NI61	221 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	ABLIM1	O14639	778 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	FSCN2	O14926	492 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	CUTA	O60888	179 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	RECQL4	O94761	1208 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM13A	O94988	1023 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	PPM1A	P35813	382 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	STAT6	P42226	847 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNQ1	P51787	676 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	NCKAP1L	P55160	1127 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	DSC1	Q08554	894 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	COL19A1	Q14993	1142 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	DYM	Q7RTS9	669 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	HACE1	Q8IYU2	909 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	MYCT1	Q8N699	235 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	CEP120	Q8N960	986 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	HLA-C	Q95604	372 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	FIZ1	Q96SL8	496 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	CDT1	Q9H211	546 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	TLR9	Q9NR96	1032 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	LZTS1	Q9Y250	596 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	GDA	Q9Y2T3	454 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	VCAN	P13611	3396 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985		F8W810	466 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	PTGES	O14684	152 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	LINC01565	O15544	149 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	PROZ	P22891	400 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	SMTN	P53814	917 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	BECN1	Q14457	450 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	E2F4	Q16254	413 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	ATL3	Q6DD88	541 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	SV2B	Q7L1I2	683 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	ZBTB33	Q86T24	672 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	DDX12P	Q92771	950 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	IGSF21	Q96ID5	467 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	ASB2	Q96Q27	587 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	IGFLR1	Q9H665	355 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	PARVG	Q9HBI0	331 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	COG5	Q9UP83	839 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	HIDE1	A8MVS5	230 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985		K7ENM7	598 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	NRP1	O14786	923 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	PER2	O15055	1255 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	TRAK2	O60296	914 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNA5	P22460	613 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	LTBR	P36941	435 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	ME1	P48163	572 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	NRIP1	P48552	1158 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT17	Q04695	432 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	STRN3	Q13033	797 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	SFR1	Q86XK3	245 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	RABGGTA	Q92696	567 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	STAM	Q92783	540 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM169	Q96HH4	297 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	TCF25	Q9BQ70	676 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		12.34	□□□□□ -0.43

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms