RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-207ENST00000551594 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 PSMD2Q13200 908 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 ALCAMQ13740 583 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 CEP120Q8N960 986 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 HELQQ8TDG4 1101 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 SMARCE1Q969G3 411 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 SNTG2Q9NY99 539 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 INSL6Q9Y581 213 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.56■□□□□ 0.88
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CTDSP2-207ENST00000551594 OSTNP61366 133 aa20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 KCNB1Q14721 858 aa20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 SEZ6Q53EL9 994 aa20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 ISM2Q6H9L7 571 aa20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 SPATA20Q8TB22 786 aa20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 PGBD4Q96DM1 585 aa20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 LRCH3Q96II8 777 aa20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 MSRAQ9UJ68 235 aa20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 GDAQ9Y2T3 454 aa20.56■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 CLDN3O15551 220 aa20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 MCF2P10911 925 aa20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 DNAJB2P25686 324 aa20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 MCL1Q07820 350 aa20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 RAB30Q15771 203 aa20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 SPRED2Q7Z698 418 aa20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 TMEM192Q8IY95 271 aa20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 CASD1Q96PB1 797 aa20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 KLK14Q9P0G3 267 aa20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 PARP2Q9UGN5 583 aa20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.55■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 TRIP11Q15643 1979 aa20.55■□□□□ 0.88
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CTDSP2-207ENST00000551594 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 GSDMAQ96QA5 445 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 TMEM206Q9H813 350 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 RSAD1Q9HA92 442 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 HCSTQ9UBK5 93 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 BIN1O00499 593 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 HOXA2O43364 376 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 HACE1Q8IYU2 909 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 ABI1Q8IZP0 508 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 ZFP42Q96MM3 310 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 GAD1Q99259 594 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 RMND1Q9NWS8 449 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 MIOSQ9NXC5 875 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 UBE4BO95155 1302 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 A0A0B4J269 797 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 LINC01553A4QN01 128 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 ARL5CA6NH57 179 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 TGFB1I1O43294 461 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 RECQL4O94761 1208 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 MLH1P40692 756 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 GRM5P41594 1212 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 GLB1LQ6UWU2 654 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 TIFAQ96CG3 184 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 GBP3Q9H0R5 595 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-207ENST00000551594 CITO14578 2027 aa20.51■□□□□ 0.87
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