RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 MLH1P40692 756 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 AMPD3Q01432 767 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 E2F4Q16254 413 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 ADALQ6DHV7 355 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 POF1BQ8WVV4 589 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 KCNN1Q92952 543 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 TCHPQ9BT92 498 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 GBP3Q9H0R5 595 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 INPPL1O15357 1258 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 POMCP01189 267 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 GAP43P17677 238 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 BCAR1P56945 870 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 KRT17Q04695 432 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 DNAJC19Q96DA6 116 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 BICD1Q96G01 975 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 RPS6KC1Q96S38 1066 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 SNTG2Q9NY99 539 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 SPG21Q9NZD8 308 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 SEL1LQ9UBV2 794 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 IDEP14735 1019 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 PLCB3Q01970 1234 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 ZPBP2Q6X784 338 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM175Q9BSA9 504 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 LZTS1Q9Y250 596 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRK-222ENST00000532751 CITO14578 2027 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 TOM1L1O75674 476 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 MCF2P10911 925 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 PBX3P40426 434 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 SCNN1GP51170 649 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 SFR1Q86XK3 245 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 SLC39A11Q8N1S5 342 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM169Q96HH4 297 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 ZFP42Q96MM3 310 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 CDT1Q9H211 546 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 KLK14Q9P0G3 267 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 TBX20Q9UMR3 447 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 TRIP11Q15643 1979 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 RECQL4O94761 1208 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 ALDH2P05091 517 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 GALTP07902 379 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 PROZP22891 400 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 CMA1P23946 247 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 NMT1P30419 496 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.441e-6■■■□□ 16.9
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PTPRK-222ENST00000532751 GRIK3Q13003 919 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 ZBTB33Q86T24 672 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF280BQ86YH2 543 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC65Q8IXS2 484 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 STAMQ92783 540 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 PPP2R3CQ969Q6 453 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 FIZ1Q96SL8 496 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 TLR9Q9NR96 1032 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 PANK4Q9NVE7 773 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 GDAQ9Y2T3 454 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 NR1I2O75469 434 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 DDHD2O94830 711 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 CSPG5O95196 566 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 GRM5P41594 1212 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 LIG4P49917 911 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 YARSP54577 528 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 MIOSQ9NXC5 875 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 DNAJB4Q9UDY4 337 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 FAN1Q9Y2M0 1017 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 MYO7AQ13402 2215 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 FRMD3A2A2Y4 597 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 CLDN3O15551 220 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 HARSP12081 509 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 DNAJB1P25685 340 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 SLC11A1P49279 550 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 CAMK1Q14012 370 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF720Q7Z2F6 126 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 HVCN1Q96D96 273 aa24.04■■□□□ 1.44
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