RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 CXCL16Q9H2A7 254 aa26.45■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIOO75962 3097 aa26.45■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 OR1G1P47890 313 aa26.44■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 MAPK6Q16659 721 aa26.44■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 KANK3Q6NY19 840 aa26.44■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 CACNG4Q9UBN1 327 aa26.44■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 DNM3Q9UQ16 869 aa26.44■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 STK24Q9Y6E0 443 aa26.44■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 ACKR2O00590 384 aa26.43■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 ALADP13716 330 aa26.43■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 MAPK7Q13164 816 aa26.43■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 NT5DC1Q5TFE4 455 aa26.43■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 HACE1Q8IYU2 909 aa26.43■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 RABGGTAQ92696 567 aa26.43■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 KIFAP3Q92845 792 aa26.43■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa26.43■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 PNMA5Q96PV4 448 aa26.43■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 PARP2Q9UGN5 583 aa26.43■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 N4BP3O15049 544 aa26.42■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 CNPP09543 421 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 CUL4AQ13619 759 aa26.42■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 PPP2R5AQ15172 486 aa26.42■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 KLHL5Q96PQ7 755 aa26.42■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 SNTG2Q9NY99 539 aa26.42■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 HIP1RO75146 1068 aa26.41■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 SOD2P04179 222 aa26.41■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 WEE2P0C1S8 567 aa26.41■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 GIT2Q14161 759 aa26.41■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 HYIQ5T013 277 aa26.41■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 RINT1Q6NUQ1 792 aa26.41■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 C1orf186Q6ZWK4 172 aa26.41■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 IFT74Q96LB3 600 aa26.41■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa26.41■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.4■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 PTGESO14684 152 aa26.4■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 NPTX2P47972 431 aa26.4■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 PEX3P56589 373 aa26.4■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 GRIK3Q13003 919 aa26.4■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 PLIN2Q99541 437 aa26.4■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 PAAF1Q9BRP4 392 aa26.4■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 ADAM7Q9H2U9 754 aa26.4■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa26.4■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 C2CD2LO14523 706 aa26.39■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 RECQL4O94761 1208 aa26.39■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 EFNA5P52803 228 aa26.39■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM132AQ24JP5 1023 aa26.39■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 TPRNQ4KMQ1 711 aa26.39■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 TAS1R3Q7RTX0 852 aa26.39■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 B3GALT6Q96L58 329 aa26.39■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 POMKQ9H5K3 350 aa26.39■■□□□ 1.82
PACSIN3-204ENST00000528201 SP100P23497 879 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 CLCN4P51793 760 aa26.38■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 KIAA0319Q5VV43 1072 aa26.38■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM87AQ8NBN3 555 aa26.38■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRC15Q8TF66 581 aa26.38■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 RPS6KC1Q96S38 1066 aa26.38■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 GPR62Q9BZJ7 368 aa26.38■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 STK39Q9UEW8 545 aa26.38■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC169A6NNP5 214 aa26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 GRIN1Q05586 938 aa26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 NAB2Q15742 525 aa26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM119Q4V9L6 283 aa26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 ATF7IP2Q5U623 682 aa26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 COLEC11Q9BWP8 271 aa26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 BACH2Q9BYV9 841 aa26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 DZANK1Q9NVP4 752 aa26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 SFI1A8K8P3 1242 aa26.36■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 PRR33A8MZF0 331 aa26.36■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 TEX28O15482 410 aa26.36■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 URODP06132 367 aa26.36■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 KLRC2P26717 231 aa26.36■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 ITIH3Q06033 890 aa26.36■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa26.36■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 FUT10Q6P4F1 479 aa26.36■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 FBXL18Q96ME1 805 aa26.36■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 CHST7Q9NS84 486 aa26.36■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 GDAQ9Y2T3 454 aa26.36■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 CASTOR2A6NHX0 329 aa26.35■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 K7ERI5 159 aa26.35■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 GUCY2CP25092 1073 aa26.35■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 GLUD2P49448 558 aa26.35■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC12A3P55017 1021 aa26.35■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 DSG1Q02413 1049 aa26.35■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 TMC5Q6UXY8 1006 aa26.35■■□□□ 1.81
PACSIN3-204ENST00000528201 PPFIBP1Q86W92 1011 aa26.35■■□□□ 1.81
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