RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518858.1

CLVS1-204, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,980 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-204ENST00000518858 FANCBQ8NB91 859 aa8.75□□□□□ -1.01
CLVS1-204ENST00000518858 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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CLVS1-204ENST00000518858 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.75□□□□□ -1.01
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CLVS1-204ENST00000518858 DISC1Q9NRI5 854 aa8.75□□□□□ -1.01
CLVS1-204ENST00000518858 PDP2Q9P2J9 529 aa8.75□□□□□ -1.01
CLVS1-204ENST00000518858 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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CLVS1-204ENST00000518858 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CLVS1-204ENST00000518858 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.73□□□□□ -1.01
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CLVS1-204ENST00000518858 ESR2Q92731 530 aa8.73□□□□□ -1.01
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