RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 SMIM5Q71RC9 77 aa7.92□□□□□ -1.14
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PDE4D-225ENST00000515835 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7.92□□□□□ -1.14
PDE4D-225ENST00000515835 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
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PDE4D-225ENST00000515835 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.92□□□□□ -1.14
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PDE4D-225ENST00000515835 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa7.87□□□□□ -1.15
PDE4D-225ENST00000515835 FAM124AQ86V42 546 aa7.87□□□□□ -1.15
PDE4D-225ENST00000515835 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.15
PDE4D-225ENST00000515835 AJUBAQ96IF1 538 aa7.87□□□□□ -1.15
PDE4D-225ENST00000515835 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa7.87□□□□□ -1.15
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