RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 HSD17B14Q9BPX1 270 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 HCSTQ9UBK5 93 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 GOLGA8IPA6NC78 632 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 GOLGA8JA6NMD2 632 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 PER2O15055 1255 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 MAFO75444 373 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 PFKMP08237 780 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP11B2P19099 503 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 NMT1P30419 496 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 KRT17Q04695 432 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC24A5Q71RS6 500 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 ZFP42Q96MM3 310 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 MINDY3Q9H8M7 445 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKEF1Q9NU02 776 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNH3Q9ULD8 1083 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 RLFQ13129 1914 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 CLDN3O15551 220 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 GJB5O95377 273 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 GPM6BQ13491 265 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 PDIA5Q14554 519 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC39A14Q15043 492 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 NOTUMQ6P988 496 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC9A7Q96T83 725 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 FTHL17Q9BXU8 183 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 PARVGQ9HBI0 331 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 CACNG4Q9UBN1 327 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHA7Q9UN72 937 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 FRMPD4Q14CM0 1322 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 EYA4O95677 639 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 GLRA2P23416 452 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 MLH1P40692 756 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 CAPSQ13938 189 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 PLPP4Q5VZY2 271 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 CRYGNQ8WXF5 182 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 KIFAP3Q92845 792 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 H3BQ06 376 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 ASAP2O43150 1006 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 EFCAB14O75071 495 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 TADA2AO75478 443 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 RFC2P35250 354 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 SCNN1GP51170 649 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP2J2P51589 502 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 CDC42EP1Q00587 391 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 RINT1Q6NUQ1 792 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 SFR1Q86XK3 245 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 LINC00301Q8NCQ3 95 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 AUTS2Q8WXX7 1259 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 PPP2R3CQ969Q6 453 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC127Q96BQ5 260 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 PGBD4Q96DM1 585 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 AAASQ9NRG9 546 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 EXOC1Q9NV70 894 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 PANK4Q9NVE7 773 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 SNTG2Q9NY99 539 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNA5P22460 613 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 NPTX2P47972 431 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 IL17AQ16552 155 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 HAUS6Q7Z4H7 955 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 USP38Q8NB14 1042 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 REEP2Q9BRK0 252 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 OCEL1Q9H607 264 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 CLDND1Q9NY35 253 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa7.15□□□□□ -1.26
RRN3P1-201ENST00000514813 PHACTR2O75167 634 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms