RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504047.1

ATXN3-208, Transcript of ataxin 3, human

TSL 3

Gene ATXN3, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-208	ENST00000504047	CCND1	P24385	295 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PTPN7	P35236	360 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC16A1	P53985	500 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PTH1R	Q03431	593 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	GGN	Q86UU5	652 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MDM1	Q8TC05	714 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MNT	Q99583	582 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	VPS11	Q9H270	941 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SCOC	Q9UIL1	159 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MATN3	O15232	486 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	RECQL4	O94761	1208 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	IL2RB	P14784	551 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	HK1	P19367	917 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MGAT1	P26572	445 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MCAM	P43121	646 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	FLT3LG	P49771	235 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	RABGGTB	P53611	331 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	EVA1C	P58658	441 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	KRT85	P78386	507 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MGAT2	Q10469	447 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	FOXE3	Q13461	319 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047		Q6ZRM9	215 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	USP51	Q70EK9	711 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SPON1	Q9HCB6	807 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	GABRD	O14764	452 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	NDUFS2	O75306	463 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	AMH	P03971	560 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	RBP3	P10745	1247 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SCNN1G	P51170	649 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	IGBP1	P78318	339 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SP140	Q13342	867 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	VPS72	Q15906	364 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	XDH	P47989	1333 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PJA2	O43164	708 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	TEX33	O43247	280 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PEX11B	O96011	259 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SREBF1	P36956	1147 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047		Q6ZVL8	140 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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