RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.67□□□□□ -0.06
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PGGT1B-204ENST00000503638 MSRAQ9UJ68 235 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-204ENST00000503638 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa14.67□□□□□ -0.06
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PGGT1B-204ENST00000503638 TNFSF13BQ9Y275 285 aa14.66□□□□□ -0.06
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PGGT1B-204ENST00000503638 KCNA1Q09470 495 aa14.65□□□□□ -0.06
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PGGT1B-204ENST00000503638 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PGGT1B-204ENST00000503638 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.63□□□□□ -0.07
PGGT1B-204ENST00000503638 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PGGT1B-204ENST00000503638 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.63□□□□□ -0.07
PGGT1B-204ENST00000503638 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.63□□□□□ -0.07
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PGGT1B-204ENST00000503638 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa14.63□□□□□ -0.07
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