RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500401.2

SPCS2P3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 2 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene SPCS2P3, Length 656 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS2P3-201ENST00000500401 CEP120Q8N960 986 aa26.59■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 HLA-CQ95604 372 aa26.59■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 FIZ1Q96SL8 496 aa26.59■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 PTPRHQ9HD43 1115 aa26.59■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 UBN1Q9NPG3 1134 aa26.59■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 TLR9Q9NR96 1032 aa26.59■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 STK17AQ9UEE5 414 aa26.59■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 TNFSF13BQ9Y275 285 aa26.59■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 GIT1Q9Y2X7 761 aa26.59■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 MYMKA6NI61 221 aa26.58■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 TNFRSF10AO00220 468 aa26.58■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 ABLIM1O14639 778 aa26.58■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 TXLNAP40222 546 aa26.58■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 KCNQ1P51787 676 aa26.58■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 NCKAP1LP55160 1127 aa26.58■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 DYMQ7RTS9 669 aa26.58■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 RSPH1Q8WYR4 309 aa26.58■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 VN1R3Q9BXE9 311 aa26.58■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 CDT1Q9H211 546 aa26.58■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 TCHHQ07283 1943 aa26.58■■□□□ 1.85
SPCS2P3-201ENST00000500401 TRIP11Q15643 1979 aa26.57■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 F8W810 466 aa26.57■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 LINC01565O15544 149 aa26.57■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 RECQL4O94761 1208 aa26.57■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 FAM13AO94988 1023 aa26.57■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 PPM1AP35813 382 aa26.57■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 COL19A1Q14993 1142 aa26.57■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 COLGALT2Q8IYK4 626 aa26.57■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 IGSF21Q96ID5 467 aa26.57■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 ASB2Q96Q27 587 aa26.57■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 IGFLR1Q9H665 355 aa26.57■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 KANSL3Q9P2N6 904 aa26.57■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 CACNG4Q9UBN1 327 aa26.57■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 PCDHA7Q9UN72 937 aa26.57■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 LZTS1Q9Y250 596 aa26.57■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 CUTAO60888 179 aa26.56■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 KRT18P05783 430 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 PROZP22891 400 aa26.56■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 DSC1Q08554 894 aa26.56■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 PLPP4Q5VZY2 271 aa26.56■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 ZBTB33Q86T24 672 aa26.56■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 MYCT1Q8N699 235 aa26.56■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa26.56■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 ADPGKQ9BRR6 497 aa26.56■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 ZHX3Q9H4I2 956 aa26.56■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 PARVGQ9HBI0 331 aa26.56■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 MARCH5Q9NX47 278 aa26.56■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 COG5Q9UP83 839 aa26.56■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 GDAQ9Y2T3 454 aa26.56■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 HIDE1A8MVS5 230 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 PTGESO14684 152 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 NRP1O14786 923 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 LTBRP36941 435 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 STAT6P42226 847 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 SMTNP53814 917 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 E2F4Q16254 413 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 HAUS6Q7Z4H7 955 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 HACE1Q8IYU2 909 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 DDX12PQ92771 950 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 STAMQ92783 540 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 DNAJC19Q96DA6 116 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 TCF25Q9BQ70 676 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 HAPLN2Q9GZV7 340 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 MUC3AQ02505 3323 aa26.54■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 PER2O15055 1255 aa26.54■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 KCNA5P22460 613 aa26.54■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 NMT1P30419 496 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 NRIP1P48552 1158 aa26.54■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 RBM10P98175 930 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 CTC1Q2NKJ3 1217 aa26.54■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 ZNF568Q3ZCX4 644 aa26.54■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 RABGGTAQ92696 567 aa26.54■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 TMEM169Q96HH4 297 aa26.54■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 TMEM175Q9BSA9 504 aa26.54■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 CLDND1Q9NY35 253 aa26.54■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 K7ENM7 598 aa26.53■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 TRAK2O60296 914 aa26.53■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 KRT17Q04695 432 aa26.53■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 BECN1Q14457 450 aa26.53■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 ATL3Q6DD88 541 aa26.53■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 EP400NLQ6ZTU2 488 aa26.53■■□□□ 1.84
SPCS2P3-201ENST00000500401 SV2BQ7L1I2 683 aa26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms