RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498804.1

TRBVA-201, Transcript of T cell receptor beta variable A (pseudogene), humanhuman

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Gene TRBVA, Length 316 nt, Biotype TR V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBVA-201ENST00000498804 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.05□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 BTNL9Q6UXG8 535 aa4.05□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 Q6ZPA2 131 aa4.05□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 SYT12Q8IV01 421 aa4.05□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF276Q8N554 614 aa4.05□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 REPS2Q8NFH8 660 aa4.05□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa4.05□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 OR14C36Q8NHC7 312 aa4.05□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 IKZF4Q9H2S9 585 aa4.05□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 GPRC5BQ9NZH0 403 aa4.05□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 SCOCQ9UIL1 159 aa4.05□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 FZD1Q9UP38 647 aa4.05□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 ULK1O75385 1050 aa4.04□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 RHOBTB3O94955 611 aa4.04□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 PPP3CAQ08209 521 aa4.04□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 UGT8Q16880 541 aa4.04□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.04□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 LY6G5CQ5SRR4 150 aa4.04□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 Q6ZVL8 140 aa4.04□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF627Q7L945 461 aa4.04□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 TEX101Q9BY14 249 aa4.04□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP4.04□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 DIRC3C9JPN6 131 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 PRAMEF4O60810 478 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 ITGA10O75578 1167 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 RPS6KA4O75676 772 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 ABHD16AO95870 558 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 GASTP01350 101 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 ITGB1P05556 798 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 OSMP13725 252 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 MGAT1P26572 445 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 FAM189BP81408 668 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 PTPAQ15257 358 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 VPS72Q15906 364 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 MST1LQ2TV78 715 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 TOR2AQ5JU69 321 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 MFSD14BQ5SR56 506 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 LRRC55Q6ZSA7 311 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 RHOUQ7L0Q8 258 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 MRGPREQ86SM8 312 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 OR52N2Q8NGI0 321 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 MDM1Q8TC05 714 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 SNX33Q8WV41 574 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 NEU1Q99519 415 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 SLC46A2Q9BY10 475 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 KCNH6Q9H252 994 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 SORCS3Q9UPU3 1222 aa4.03□□□□□ -1.76
TRBVA-201ENST00000498804 GAGE12BA1L429 117 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 GOLGA8AA7E2F4 631 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 AHRRA9YTQ3 701 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 B5MCH6 92 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 LEFTY2O00292 366 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 FOXN1O15353 648 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 BRINP1O60477 761 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 PPFIA2O75334 1257 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 KRT4P19013 534 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 CNGA1P29973 690 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 TAP1Q03518 808 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 ADRM1Q16186 407 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 MUM1Q2TAK8 710 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 TIGD2Q4W5G0 525 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 LAIR1Q6GTX8 287 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 KCNV1Q6PIU1 500 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 SLC35B2Q8TB61 432 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 WDR66Q8TBY9 1149 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 ACAP3Q96P50 834 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 SLC2A13Q96QE2 648 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 NDC1Q9BTX1 674 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 GPRC5DQ9NZD1 345 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 DMRT1Q9Y5R6 373 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 ATRNL1Q5VV63 1379 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 PHLDB1Q86UU1 1377 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa4.02□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 PHF2O75151 1096 aa4.01□□□□□ -1.77
TRBVA-201ENST00000498804 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
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