RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494815.1

TSPAN4-212, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,187 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-212ENST00000494815 TMC2Q8TDI7 906 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 TRIM66O15016 1216 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 PPP3CAQ08209 521 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 KIF5AQ12840 1032 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 CAPSQ13938 189 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 RGMBQ6NW40 437 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 CCDC102AQ96A19 550 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 SAAL1Q96ER3 474 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 TINF2Q9BSI4 451 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 ADCY3O60266 1144 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 ANXA13P27216 316 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 PRKCIP41743 596 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 EFNA5P52803 228 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 IQCEQ6IPM2 695 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 LMO3Q8TAP4 145 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 CPA4Q9UI42 421 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 TRPC6Q9Y210 931 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 SIP14410 1827 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 MXI1P50539 228 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 INHBEP58166 350 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 STK33Q9BYT3 514 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 GTF2H1P32780 548 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 GCLMP48507 274 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 EPC2Q52LR7 807 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 YY1AP1Q9H869 796 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 USP20Q9Y2K6 914 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 RCCD1A6NED2 376 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 EXTL3O43909 919 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 LGALS2P05162 132 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 FERP16591 822 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 STAT1P42224 750 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 CYP24A1Q07973 514 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 DRP2Q13474 957 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 IRF5Q13568 498 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 SLC18A3Q16572 532 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 DNAJC12Q9UKB3 198 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 SLC10A3P09131 477 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 ARID5AQ03989 594 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 DUSP28Q4G0W2 176 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 MORN1Q5T089 497 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 GJB7Q6PEY0 223 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 ZNF233A6NK53 670 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 F8VZ95 297 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 PJA2O43164 708 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 PPFIA4O75335 1185 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 MAGEA1P43355 309 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 ACVR2BQ13705 512 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 ZPBP2Q6X784 338 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 AFG1LQ8WV93 481 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 PASKQ96RG2 1323 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 MCM3P25205 808 aa20.02■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 PTK2Q05397 1052 aa20.02■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 KRT39Q6A163 491 aa20.02■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.02■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.02■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.02■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.02■□□□□ 0.8
TSPAN4-212ENST00000494815 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms