RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 C1orf186Q6ZWK4 172 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 SUSD6Q92537 303 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 COLEC11Q9BWP8 271 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 PARP2Q9UGN5 583 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 GUCY2CP25092 1073 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 CA8P35219 290 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 OR1G1P47890 313 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 RBM10P98175 930 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 GRIK3Q13003 919 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 GSTCDQ8NEC7 633 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 RPS6KC1Q96S38 1066 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 S1PR5Q9H228 398 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM134Q9H6X4 195 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 MIOSQ9NXC5 875 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC169A6NNP5 214 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 HIP1RO75146 1068 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 NPTX2P47972 431 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 ITIH3Q06033 890 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 LLGL2Q6P1M3 1020 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 SYCE2Q6PIF2 218 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 VN1R3Q9BXE9 311 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 DZANK1Q9NVP4 752 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 GPR37L1O60883 481 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 SOD2P04179 222 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 UBA7P41226 1012 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 PEX3P56589 373 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPN14Q15678 1187 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 CES5AQ6NT32 575 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 KCNK18Q7Z418 384 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 GPR65Q8IYL9 337 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP26.06■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 PNMA5Q96PV4 448 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 KIFC3Q9BVG8 833 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 RUSC1Q9BVN2 902 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 MARCH5Q9NX47 278 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 C5orf42Q9H799 3197 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 TTLL13PA6NNM8 815 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 DCXO43602 365 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 LIG1P18858 919 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM31Q5JXX7 168 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 ATF7IP2Q5U623 682 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 CABP7Q86V35 215 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 DAW1Q8N136 415 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 ADAM7Q9H2U9 754 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 POLD4Q9HCU8 107 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 KMT5AQ9NQR1 393 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 KLK14Q9P0G3 267 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 TNFSF13BQ9Y275 285 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 LILRB3O75022 631 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 EFEMP2O95967 443 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 URODP06132 367 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 LONP1P36776 959 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM119Q4V9L6 283 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 NT5DC1Q5TFE4 455 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC22A17Q8WUG5 538 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 SPIRE2Q8WWL2 714 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 AUTS2Q8WXX7 1259 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 CALML4Q96GE6 196 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 NECTIN4Q96NY8 510 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 SNTG2Q9NY99 539 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 LOC730098B7Z3J9 87 aa26.03■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 PLA2G4BP0C869 781 aa26.03■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 SMTNP53814 917 aa26.03■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC12A3P55017 1021 aa26.03■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 MAPK7Q13164 816 aa26.03■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 TUSC3Q13454 348 aa26.03■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 RECQL4O94761 1208 aa26.02■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 C1RP00736 705 aa26.02■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 THP07101 528 aa26.02■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 KLHL5Q96PQ7 755 aa26.02■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 DPP7Q9UHL4 492 aa26.02■■□□□ 1.76
CTDSP1-211ENST00000492545 EDN1P05305 212 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDSP1-211ENST00000492545 CNPP09543 421 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CTDSP1-211ENST00000492545 PLS3P13797 630 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDSP1-211ENST00000492545 SYT1P21579 422 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDSP1-211ENST00000492545 SCP2P22307 547 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDSP1-211ENST00000492545 KLRC2P26717 231 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDSP1-211ENST00000492545 GLUD2P49448 558 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDSP1-211ENST00000492545 EEF1DP3Q658K8 133 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDSP1-211ENST00000492545 KIAA1841Q6NSI8 718 aa26.01■■□□□ 1.75
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