RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492262.1

ZNF638-223, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 2

Gene ZNF638, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-223	ENST00000492262	RTP5	Q14D33	572 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	BTBD2	Q9BX70	525 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	CSRNP2	Q9H175	543 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	DNM3	Q9UQ16	869 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	RGPD5	Q99666	1765 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	AP1G1	O43747	822 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	HSPA6	P17066	643 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	VIPR1	P32241	457 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	BCAR1	P56945	870 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	ADRM1	Q16186	407 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	ALG3	Q92685	438 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	LRGUK	Q96M69	825 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	RNF38	Q9H0F5	515 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	OR10A5	Q9H207	317 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	IPP	Q9Y573	584 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ZNF638-223	ENST00000492262	USP6	P35125	1406 aa		6.65	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	KIF1A	Q12756	1690 aa		6.65	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	APOL3	O95236	402 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	GLI1	P08151	1106 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	NKX3-2	P78367	333 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	IL13RA1	P78552	427 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	TMC6	Q7Z403	805 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	WDR63	Q8IWG1	891 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	PJA1	Q8NG27	643 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	CALML6	Q8TD86	181 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	SYT3	Q9BQG1	590 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	SOX7	Q9BT81	388 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	DLL4	Q9NR61	685 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	OFD1	O75665	1012 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	PCDH8	O95206	1070 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	ATF2	P15336	505 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	GPR15	P49685	360 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	MALL	Q13021	153 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	SPIDR	Q14159	915 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	VASN	Q6EMK4	673 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	USP45	Q70EL2	814 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	GAREM2	Q75VX8	874 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	MIER2	Q8N344	545 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	POLK	Q9UBT6	870 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	STRC	Q7RTU9	1775 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	ALS2	Q96Q42	1657 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	PLIN1	O60240	522 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	PAPLN	O95428	1278 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	HRG	P04196	525 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	PDC	P20941	246 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	PDE6B	P35913	854 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	MC3R	P41968	323 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	PPARA	Q07869	468 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	PPP3CA	Q08209	521 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	ADAM9	Q13443	819 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	KSR2	Q6VAB6	950 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF638-223	ENST00000492262	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		6.62	□□□□□ -1.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms