RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491274.5

SDHB-208, Transcript of succinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit B, humanhuman

TSL 5

Gene SDHB, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHB-208ENST00000491274 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 TMEM161AQ9NX61 479 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 MTMR6Q9Y217 621 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 MYH7BA7E2Y1 1941 aa7.37□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 LTBP2Q14767 1821 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 EPOPA6NHQ4 379 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 CCDC169A6NNP5 214 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 E9PMD0 336 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 CSPG5O95196 566 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 EYA4O95677 639 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 RECKO95980 971 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 KRT18P05783 430 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 RB1P06400 928 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 GLRA2P23416 452 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 TXLNAP40222 546 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 GATMP50440 423 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PTENP60484 403 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 POU5F1BQ06416 359 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 RESTQ13127 1097 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 CAPSQ13938 189 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 BECN1Q14457 450 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 STK38Q15208 465 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 NOTUMQ6P988 496 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 GLB1LQ6UWU2 654 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 EP400NLQ6ZTU2 488 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 SPRED2Q7Z698 418 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 HACE1Q8IYU2 909 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 GDPD5Q8WTR4 605 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 BAP1Q92560 729 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 KIFAP3Q92845 792 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ASB16Q96NS5 453 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 TMEM117Q9H0C3 514 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 C2orf40Q9H1Z8 148 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 CLIC4Q9Y696 253 aa7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 H3BNC9 293 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 K7ERI5 159 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PLA2G4BP0C869 781 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 WEE1P30291 646 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 AXLP30530 894 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 NAMPTP43490 491 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 RAB27AP51159 221 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PEX3P56589 373 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 KRT17Q04695 432 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 MAPK6Q16659 721 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 SPECC1Q5M775 1068 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 THNSL1Q8IYQ7 743 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 CNNM3Q8NE01 707 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 URGCPQ8TCY9 931 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 HELQQ8TDG4 1101 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 CPB2Q96IY4 423 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 DRC1Q96MC2 740 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 APOL6Q9BWW8 343 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PLVAPQ9BX97 442 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ZHX3Q9H4I2 956 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 MINDY3Q9H8M7 445 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 LMCD1Q9NZU5 365 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 MTCH2Q9Y6C9 303 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 LAMA3Q16787 3333 aa7.35□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 SLC26A4O43511 780 aa7.34□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 TSPAN1O60635 241 aa7.34□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 HIP1RO75146 1068 aa7.34□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ITGA4P13612 1032 aa7.34□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 LAG3P18627 525 aa7.34□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 EFNA5P52803 228 aa7.34□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 SMTNP53814 917 aa7.34□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 MBTD1Q05BQ5 628 aa7.34□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SDHB-208ENST00000491274 SLC39A14Q15043 492 aa7.34□□□□□ -1.23
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