RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 RUBCNQ92622 972 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 TMEM143Q96AN5 459 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 EHD4Q9H223 541 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 C17orf75Q9HAS0 396 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 MYMKA6NI61 221 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 RRN3P2A6NIE6 340 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 KBTBD13C9JR72 458 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 CD4P01730 458 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 ICAM1P05362 532 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 TADA2BQ86TJ2 420 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 AFG1LQ8WV93 481 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 ZBBXA8MT70 800 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 CREB3O43889 395 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 CPB1P15086 417 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 CAP2P40123 477 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 FMO5P49326 533 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 LAMC2Q13753 1193 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 MOXD1Q6UVY6 613 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 FAM96AQ9H5X1 160 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 UVRAGQ9P2Y5 699 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 MEGF6O75095 1541 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 MST1RQ04912 1400 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 FOXP2O15409 715 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 P4HA2O15460 535 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 CSPG5O95196 566 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 FDPSP14324 419 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 LIG3P49916 1009 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 PLAAQ9Y263 795 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 RCN2Q14257 317 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 AGAP1Q9UPQ3 857 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 COPEO14579 308 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 BNIP3LO60238 219 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 SERPINB6P35237 376 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 SREBF2Q12772 1141 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 SPARCL1Q14515 664 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 TMEM132DQ14C87 1099 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 TEX2Q8IWB9 1127 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 SLC38A7Q9NVC3 462 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 FGFR2P21802 821 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 MUTP22033 750 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 APPL2Q8NEU8 664 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 POLLQ9UGP5 575 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 ROR1Q01973 937 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 SAMD7Q7Z3H4 446 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 C18orf8Q96DM3 657 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 KCNB2Q92953 911 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 ATG4CQ96DT6 458 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 EFHD1Q9BUP0 239 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 KCNH7Q9NS40 1196 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 SLIT1O75093 1534 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 CYP26A1O43174 497 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 SNCBQ16143 134 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 MIPOL1Q8TD10 442 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 GANCQ8TET4 914 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 BFARQ9NZS9 450 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 SPDYE2BA6NHP3 402 aa18.08■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 SPDYE6P0CI01 402 aa18.08■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 SLC18A3Q16572 532 aa18.08■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 SRGAP2O75044 1071 aa18.08■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 NUDT12Q9BQG2 462 aa18.08■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 CLGNO14967 610 aa18.08■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 NCOA4Q13772 614 aa18.08■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 HPS5Q9UPZ3 1129 aa18.08■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.08■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 KPNA7A9QM74 516 aa18.08■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 GTF2A2P52657 109 aa18.08■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 DGKDQ16760 1214 aa18.08■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 TRIM67Q6ZTA4 783 aa18.08■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 TRIM59Q8IWR1 403 aa18.08■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 AGBL1Q96MI9 1066 aa18.08■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 KIF3CO14782 793 aa18.08■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 RAD51Q06609 339 aa18.08■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 STK4Q13043 487 aa18.08■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 CRLF3Q8IUI8 442 aa18.08■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 SH3TC2Q8TF17 1288 aa18.08■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 KLHL29Q96CT2 875 aa18.08■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 CYP2C19P33261 490 aa18.07■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 HUNKP57058 714 aa18.07■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 MTFR1LQ9H019 292 aa18.07■□□□□ 0.48
NISCH-213ENST00000489895 SP110Q9HB58 689 aa18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms