RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS36Q86VN1 386 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPM1KQ8N3J5 372 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GIMAP7Q8NHV1 300 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTLL13PA6NNM8 815 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP2C8P10632 490 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACOT2P49753 483 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GALCP54803 685 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GUCY1A3Q02108 690 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITIH3Q06033 890 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPFIA1Q13136 1202 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEP85LQ5SZL2 805 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPNE8Q86YQ8 564 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEMA4DQ92854 862 aa16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF233A6NK53 670 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 F8VZ95 297 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNGA1P29973 690 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STAT1P42224 750 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VAMP7P51809 220 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERVK-9P63128 1117 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNV1Q6PIU1 500 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TPCN2Q8NHX9 752 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POMGNT1Q8WZA1 660 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACCSQ96QU6 501 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM213AQ9BRX8 229 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR88Q9GZN0 384 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DMAC2Q9NW81 257 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STK24Q9Y6E0 443 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LTBP3Q9NS15 1303 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPFIA4O75335 1185 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT13P13646 458 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT76Q01546 638 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRIQ4A6NIV6 560 aa16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C4orf19Q8IY42 314 aa16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYT17Q9BSW7 474 aa16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GDF3Q9NR23 364 aa16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXC10Q9NYD6 342 aa16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBX20Q9UMR3 447 aa16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SART1O43290 800 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARIH2O95376 493 aa16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EDN1P05305 212 aa16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XXYLT1Q8NBI6 393 aa16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGEF26Q96DR7 871 aa16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STRA6Q9BX79 667 aa16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLAAQ9Y263 795 aa16.72■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOWAHBA6NEL2 793 aa16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C19orf81C9J6K1 198 aa16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM117Q9H0C3 514 aa16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEUROG2Q9H2A3 272 aa16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NR2E1Q9Y466 385 aa16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTI1O43156 1089 aa16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DAPK3O43293 454 aa16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAX7P23759 505 aa16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FLT3P36888 993 aa16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 JAK3P52333 1124 aa16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 JAM2P57087 298 aa16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPOPLQ6IQ16 392 aa16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC71Q8N4P6 559 aa16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAS1R2Q8TE23 839 aa16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPON1Q9HCB6 807 aa16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEL1LQ9UBV2 794 aa16.71■□□□□ 0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HTTP42858 3142 aa16.71■□□□□ 0.26
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.26
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STBD1O95210 358 aa16.71■□□□□ 0.26
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.26
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AADACL2Q6P093 401 aa16.71■□□□□ 0.26
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LLGL2Q6P1M3 1020 aa16.71■□□□□ 0.26
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAS1R3Q7RTX0 852 aa16.71■□□□□ 0.26
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.26
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BTBD6Q96KE9 485 aa16.71■□□□□ 0.26
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP26B1Q9NR63 512 aa16.71■□□□□ 0.26
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa16.71■□□□□ 0.26
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LCTP09848 1927 aa16.71■□□□□ 0.26
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC26A4O43511 780 aa16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms