RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486667.5

SRSF11-215, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 11, human

TSL 5

Gene SRSF11, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRSF11-215	ENST00000486667	CCDC175	P0C221	793 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	GNAT1	P11488	350 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	VEGFB	P49765	207 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PRMT2	P55345	433 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	DLG4	P78352	724 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PPP3CA	Q08209	521 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SURF1	Q15526	300 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	KRT39	Q6A163	491 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	LMO3	Q8TAP4	145 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SAAL1	Q96ER3	474 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	AKT3	Q9Y243	479 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SRSF11-215	ENST00000486667	USP27X	A6NNY8	438 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	GPR25	O00155	361 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	FAM189A1	O60320	539 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	NDUFA10	O95299	355 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	LCA5L	O95447	670 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	SERPING1	P05155	500 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	GJB1	P08034	283 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	MYL3	P08590	195 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	RARB	P10826	455 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	ACTN1	P12814	892 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	ANXA13	P27216	316 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	MXI1	P50539	228 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	GPC3	P51654	580 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	AP3M2	P53677	418 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	JAM2	P57087	298 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	CAP1	Q01518	475 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	KYAT1	Q16773	422 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	NME8	Q8N427	588 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	ERO1A	Q96HE7	468 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	NLRP4	Q96MN2	994 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	STK33	Q9BYT3	514 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	SETD4	Q9NVD3	440 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	CIT	O14578	2027 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667		A0A087WZ62	844 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	HMGCR	P04035	888 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	PRKCI	P41743	596 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	GCLM	P48507	274 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	KRT83	P78385	493 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	BEX3	Q00994	111 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	MTF1	Q14872	753 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	PTPN14	Q15678	1187 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	AMHR2	Q16671	573 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SRSF11-215	ENST00000486667	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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