RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SPTLC3Q9NUV7 552 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CAPN11Q9UMQ6 739 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CASZ1Q86V15 1759 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 KCNK3O14649 394 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 STAG3L1P0CL83 205 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 MAP3K10Q02779 954 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 C1orf186Q6ZWK4 172 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 KCNK18Q7Z418 384 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 TAX1BP1Q86VP1 789 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 PPTC7Q8NI37 304 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 MAML3Q96JK9 1138 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 GNA15P30679 374 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SARSP49591 514 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 TTI2Q6NXR4 508 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 OSMRQ99650 979 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 STK33Q9BYT3 514 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 ADAM22Q9P0K1 906 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 COL20A1Q9P218 1284 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SOX5P35711 763 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CYP27A1Q02318 531 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CRHR2Q13324 411 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 ZPBP2Q6X784 338 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 ILDR2Q71H61 639 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CEP57Q86XR8 500 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 DNAJB3Q8WWF6 145 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SEPT8Q92599 483 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 VAV3Q9UKW4 847 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CHD4Q14839 1912 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 A6NJR5 290 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 GAS8O95995 478 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CALB1P05937 261 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 PNPLA4P41247 253 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 APLP1P51693 650 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 NR1I3Q14994 352 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 LONRF2Q1L5Z9 754 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CXCL17Q6UXB2 119 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 PDE11AQ9HCR9 933 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SNX9Q9Y5X1 595 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM150BA6NC51 233 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 HOXA2O43364 376 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 PGK1P00558 417 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 RASAL3Q86YV0 1011 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 NCAPGQ9BPX3 1015 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CBWD1Q9BRT8 395 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 LCMT1Q9UIC8 334 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 E7EVH7 732 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 ACKR2O00590 384 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 NDC80O14777 642 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 GNRH1P01148 92 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 HLA-DRAP01903 254 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 UCHL3P15374 230 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 AXLP30530 894 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 GTF2H1P32780 548 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 STILQ15468 1287 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 IL17AQ16552 155 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SV2CQ496J9 727 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 HYIQ5T013 277 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 PDXDC1Q6P996 788 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 ACRBPQ8NEB7 543 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 APPL2Q8NEU8 664 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 RNF139Q8WU17 664 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 PDGFCQ9NRA1 345 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 PYCARDQ9ULZ3 195 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SLX4Q8IY92 1834 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB39O15060 712 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 PEX10O60683 326 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 TADA2AO75478 443 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 RHOXF2BP0C7M4 288 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms