RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476539.5

SUPT20H-214, Transcript of SPT20 homolog, SAGA complex component, humanhuman

TSL 3

Gene SUPT20H, Length 528 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20H-214ENST00000476539 APOL5Q9BWW9 433 aa5.1□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 C22orf23Q9BZE7 217 aa5.1□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 RSAD1Q9HA92 442 aa5.1□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 PTPRHQ9HD43 1115 aa5.1□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.1□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 LANCL2Q9NS86 450 aa5.1□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 FAM53CQ9NYF3 392 aa5.1□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa5.1□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 TPCN1Q9ULQ1 816 aa5.1□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 A0A1W2PPL8 197 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 RHPN2P1A8MT19 583 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 ADAM23O75077 832 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 GPR32O75388 356 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 PAPLNO95428 1278 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 GASTP01350 101 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 COL6A1P12109 1028 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 CRHR1P34998 444 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 SLC6A9P48067 706 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 MEOX1P50221 254 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 STAT5BP51692 787 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 KCNQ1P51787 676 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 FOXO4P98177 505 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 TMEM132EQ6IEE7 984 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 ERAP2Q6P179 960 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 ABHD15Q6UXT9 468 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 CLEC14AQ86T13 490 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 STK32CQ86UX6 486 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 OR2C3Q8N628 320 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 OR7D4Q8NG98 312 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 PPM1EQ8WY54 764 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 APIPQ96GX9 242 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 TMX3Q96JJ7 454 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 MRGPRX4Q96LA9 322 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 PDCD2LQ9BRP1 358 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 WDCPQ9H6R7 721 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 ARFGAP3Q9NP61 516 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 TLR9Q9NR96 1032 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 PADI4Q9UM07 663 aa5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SUPT20H-214ENST00000476539 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 H3BUI4 141 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 NRP1O14786 923 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 MTSS1O43312 755 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ALDH1A2O94788 518 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 MYF5P13349 255 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 TYRP14679 529 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 GYPEP15421 78 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ZNF28P17035 718 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ITGB5P18084 799 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 TRAPPC10P48553 1259 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 TLE1Q04724 770 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 RAPGEF1Q13905 1077 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 UBE3CQ15386 1083 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ANO1Q5XXA6 986 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 Q6ZVL8 140 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 PQLC1Q8N2U9 271 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 PLBD2Q8NHP8 589 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 IFI44Q8TCB0 444 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 PHKBQ93100 1093 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 DIRC2Q96SL1 478 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 TBCBQ99426 244 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 SYT3Q9BQG1 590 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 MCOLN1Q9GZU1 580 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ARMT1Q9H993 441 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 L2HGDHQ9H9P8 463 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 TMEM140Q9NV12 185 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ABCF2Q9UG63 623 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 SIK3Q9Y2K2 1263 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 SNX13Q9Y5W8 968 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa5.08□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ISM1B1AKI9 464 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 TEX33O43247 280 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 KLHL18O94889 574 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 SMARCA1P28370 1054 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 SREBF1P36956 1147 aa5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms