RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	AKR1B10	O60218	316 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	TOM1L1	O75674	476 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	MYL3	P08590	195 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	CYBA	P13498	195 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	GTF2H1	P32780	548 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	ACOT2	P49753	483 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	CHMP4BP1	P59074	171 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	ARID5A	Q03989	594 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	PRKCZ	Q05513	592 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	KIF22	Q14807	665 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	SPA17	Q15506	151 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT39	Q6A163	491 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	ZBTB33	Q86T24	672 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	TRPV1	Q8NER1	839 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	KIF18A	Q8NI77	898 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	LMO3	Q8TAP4	145 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	KAT2B	Q92831	832 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	FZD8	Q9H461	694 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-231	ENST00000467435		F8VZ95	297 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	ACKR2	O00590	384 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	CLDN3	O15551	220 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	ZEB2	O60315	1214 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	LCA5L	O95447	670 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	VTN	P04004	478 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	FER	P16591	822 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	STAT1	P42224	750 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	ARHGAP25	P42331	645 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	FLT3LG	P49771	235 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	PSEN2	P49810	448 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	APLP1	P51693	650 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	BEX3	Q00994	111 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	SCLT1	Q96NL6	688 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	STK33	Q9BYT3	514 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	SETD4	Q9NVD3	440 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	DNAI1	Q9UI46	699 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A087WZ62	844 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	ABLIM1	O14639	778 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF263	O14978	683 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	B4GALT5	O43286	388 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	KIF5C	O60282	957 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	PROZ	P22891	400 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	SOX5	P35711	763 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	GPC3	P51654	580 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	VAV2	P52735	878 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	GNG11	P61952	73 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	CYP27A1	Q02318	531 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	SP3	Q02447	781 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	MCL1	Q07820	350 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	NLRP7	Q8WX94	980 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-231	ENST00000467435	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28

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