RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 USO1O60763 962 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERLIN2O94905 339 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALDH2P05091 517 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 ITGA4P13612 1032 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 CA8P35219 290 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTHFRP42898 656 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 GIT2Q14161 759 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 NAB2Q15742 525 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 CES5AQ6NT32 575 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOTUMQ6P988 496 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 POTEGQ6S5H5 508 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMC5Q6UXY8 1006 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 C4orf32Q8N8J7 132 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 KREMEN2Q8NCW0 462 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 CNNM3Q8NE01 707 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC51Q96ER9 411 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 B3GALT6Q96L58 329 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 RIPOR3Q96MK2 946 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAAF1Q9BRP4 392 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 RXFP1Q9HBX9 757 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHST7Q9NS84 486 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAN1Q9Y2M0 1017 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 NR2E1Q9Y466 385 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATG2BQ96BY7 2078 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 EML5Q05BV3 1969 aa9.39□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTGESO14684 152 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 TEX28O15482 410 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPTXRO95502 500 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 AKAP5P24588 427 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 AVPR2P30518 371 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 MCM7P33993 719 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 DSG1Q02413 1049 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM187BQ17R55 369 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAEAQ7L5Y9 396 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 RABGGTAQ92696 567 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 APOL6Q9BWW8 343 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 FZD8Q9H461 694 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 TUFT1Q9NNX1 390 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAN1C1Q9NR34 630 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 USTQ9Y2C2 406 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP20Q9Y2K6 914 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 GIT1Q9Y2X7 761 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTPRDP23468 1912 aa9.38□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPAG17Q6Q759 2223 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 C2CD2LO14523 706 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 RFPL2O75678 378 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 NEFLP07196 543 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPA1P27694 616 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR1G1P47890 313 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 TFDP1Q14186 410 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 NBR1Q14596 966 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 FUT10Q6P4F1 479 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC27A1Q6PCB7 646 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 LILRA6Q6PI73 481 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPFIBP1Q86W92 1011 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM105Q8N8V8 129 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDZD7Q9H5P4 517 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 POLD4Q9HCU8 107 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLK14Q9P0G3 267 aa9.37□□□□□ -0.91
GAPDHP28-201ENST00000455134 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms