RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443509.6

PRUNE2-208, Transcript of prune homolog 2, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PRUNE2, Length 12,356 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRUNE2-208	ENST00000443509	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	SNAPC5	O75971	98 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	KRT37	O76014	449 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	POTEI	P0CG38	1075 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PHKA1	P46020	1223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PNMA3	Q9UL41	463 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ALOX5	P09917	674 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PYGM	P11217	842 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ITIH4	Q14624	930 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RAB20	Q9NX57	234 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	KRT14	P02533	472 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	DNA2	P51530	1060 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	OTUD5	Q96G74	571 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MRI	Q9BWK5	157 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ECEL1	O95672	775 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	NFKBIA	P25963	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	VPS72	Q15906	364 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	DYDC2	Q96IM9	177 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	DOCK2	Q92608	1830 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RSPH10B	P0C881	870 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TXK	P42681	527 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MYL7	Q01449	175 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	KAZN	Q674X7	775 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	FLCN	Q8NFG4	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	BMP3	P12645	472 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MYO1F	O00160	1098 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	APOL1	O14791	398 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TRIM66	O15016	1216 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ACTN1	P12814	892 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	BTD	P43251	543 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PICALM	Q13492	652 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRUNE2-208	ENST00000443509	BACH1	O14867	736 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRUNE2-208	ENST00000443509	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRUNE2-208	ENST00000443509	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRUNE2-208	ENST00000443509	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRUNE2-208	ENST00000443509	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRUNE2-208	ENST00000443509	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRUNE2-208	ENST00000443509	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRUNE2-208	ENST00000443509	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRUNE2-208	ENST00000443509	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRUNE2-208	ENST00000443509	CDH24	Q86UP0	819 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRUNE2-208	ENST00000443509	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRUNE2-208	ENST00000443509	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRUNE2-208	ENST00000443509	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRUNE2-208	ENST00000443509	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRUNE2-208	ENST00000443509	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62

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