RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440048.1

VARS-217, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VARS, Length 804 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-217ENST00000440048 STK17AQ9UEE5 414 aa26.01■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 PARP2Q9UGN5 583 aa26.01■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 KCNG1Q9UIX4 513 aa26.01■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 ODF2LQ9ULJ1 636 aa26.01■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 CARNS1A5YM72 827 aa26■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 FSCN2O14926 492 aa26■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 PPP6R2O75170 966 aa26■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 SCNN1GP51170 649 aa26■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 SMTNP53814 917 aa26■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 GIT2Q14161 759 aa26■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 RRAGBQ5VZM2 374 aa26■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa26■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 KLK14Q9P0G3 267 aa26■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 NCK2O43639 380 aa25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 BMP1P13497 986 aa25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 KCNQ1P51787 676 aa25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 GSTCDQ8NEC7 633 aa25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 PPP2R3CQ969Q6 453 aa25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 TMEM169Q96HH4 297 aa25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 IGSF21Q96ID5 467 aa25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 TMEM175Q9BSA9 504 aa25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 IGFLR1Q9H665 355 aa25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 SNTG2Q9NY99 539 aa25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 TNFSF13BQ9Y275 285 aa25.99■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 MAPTP10636 758 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 KCNA5P22460 613 aa25.98■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 PLPP4Q5VZY2 271 aa25.98■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 TCF25Q9BQ70 676 aa25.98■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa25.98■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 CLDND1Q9NY35 253 aa25.98■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 A0A087X0B3 334 aa25.97■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 TNFRSF10AO00220 468 aa25.97■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 FAM13AO94988 1023 aa25.97■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 ALDH2P05091 517 aa25.97■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 NRIP1P48552 1158 aa25.97■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 ZNF131P52739 623 aa25.97■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 NCKAP1LP55160 1127 aa25.97■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 DSC1Q08554 894 aa25.97■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 CTC1Q2NKJ3 1217 aa25.97■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.97■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 EP400NLQ6ZTU2 488 aa25.97■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 COLGALT2Q8IYK4 626 aa25.97■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 MYCT1Q8N699 235 aa25.97■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 PANK2Q9BZ23 570 aa25.97■■□□□ 1.75
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VARS-217ENST00000440048 PTPRHQ9HD43 1115 aa25.97■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 FAN1Q9Y2M0 1017 aa25.97■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 RECQL4O94761 1208 aa25.96■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 STRN3Q13033 797 aa25.96■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 ATL3Q6DD88 541 aa25.96■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 TMC7Q7Z402 723 aa25.96■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 CDT1Q9H211 546 aa25.96■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 TLE6Q9H808 572 aa25.96■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 TRIP11Q15643 1979 aa25.96■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 MUC3AQ02505 3323 aa25.95■■□□□ 1.75
VARS-217ENST00000440048 NRP1O14786 923 aa25.95■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 LINC01565O15544 149 aa25.95■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 CUTAO60888 179 aa25.95■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 BRD1O95696 1058 aa25.95■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 LTBRP36941 435 aa25.95■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
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VARS-217ENST00000440048 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 RPS6KC1Q96S38 1066 aa25.95■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.95■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 GDAQ9Y2T3 454 aa25.95■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.95■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 HIDE1A8MVS5 230 aa25.94■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 H0YCG3 227 aa25.94■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 H3BQ06 376 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 PER2O15055 1255 aa25.94■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 TBCAO75347 108 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 PROZP22891 400 aa25.94■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 STAT6P42226 847 aa25.94■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 OR1G1P47890 313 aa25.94■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 GRIK3Q13003 919 aa25.94■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 ADAM15Q13444 863 aa25.94■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 ZNF568Q3ZCX4 644 aa25.94■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 SV2BQ7L1I2 683 aa25.94■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 DYMQ7RTS9 669 aa25.94■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 HAUS6Q7Z4H7 955 aa25.94■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 ZBTB33Q86T24 672 aa25.94■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 VPS52Q8N1B4 723 aa25.94■■□□□ 1.74
VARS-217ENST00000440048 EFHBQ8N7U6 833 aa25.94■■□□□ 1.74
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