RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 NFKBIEO00221 500 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 TUBBP07437 444 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 NSFP46459 744 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP2R5CQ13362 524 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 TBX20Q9UMR3 447 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 DAW1Q8N136 415 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 ZIM3Q96PE6 472 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 ALG6Q9Y672 507 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 TUBB4BP68371 445 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 SEMA3FQ13275 785 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF149Q8NC42 400 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 ATG4AQ8WYN0 398 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 NRAPQ86VF7 1730 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 ACSL3O95573 720 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 MYZAPP0CAP1 466 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 PTPRAP18433 802 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 JAK3P52333 1124 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 KRT39Q6A163 491 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 BSNDQ8WZ55 320 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 KRT35Q92764 455 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 WEE2P0C1S8 567 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 COMTP21964 271 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 ANO5Q75V66 913 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXO40Q9UH90 709 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 MYO1FO00160 1098 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM66O15016 1216 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 CLDN3O15551 220 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 DR1Q01658 176 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 CALCOCO2Q13137 446 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 KCTD2Q14681 263 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM83AQ86UY5 434 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 COPS5Q92905 334 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 SEL1LQ9UBV2 794 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 AKT3Q9Y243 479 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 USP38Q8NB14 1042 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 MTUS1Q9ULD2 1270 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 NR2E1Q9Y466 385 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 SLX4Q8IY92 1834 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 SCN7AQ01118 1682 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 TREML2Q5T2D2 321 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 RFFLQ8WZ73 363 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 IWS1Q96ST2 819 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 MRIQ9BWK5 157 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM7Q9C029 511 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 LIG3P49916 1009 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 EMC2Q15006 297 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 HYIQ5T013 277 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 32.1
RABGEF1-210ENST00000437078 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 AIPL1Q9NZN9 384 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1B0GUA9 196 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 FGFR4P22455 802 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 ACTN2P35609 894 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 GPC5P78333 572 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR162Q16538 588 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 SV2AQ7L0J3 742 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 C18orf8Q96DM3 657 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 MED4Q9NPJ6 270 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP8B1O43520 1251 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 CYP2C19P33261 490 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 ADCY8P40145 1251 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 PPATQ06203 517 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 PPFIA1Q13136 1202 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGEF1-210ENST00000437078 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms